The Hemoglobins Of The Sub-Antarctic Fish Cottoperca Gobio, A Phyletically Basal Species – Oxygen-Binding Equilibria, Kinetics And Molecular Dynamics

The Hemoglobins of the Sub-Antarctic Fish Cottoperca Gobio, a Phyletically Basal Species – Oxygen-Binding Equilibria, Kinetics and Molecular Dynamics

Tác giả: Daniela Giordano, Leonardo Boechi, Alessandro Vergara, Marcelo A. Martí, Uri Samuni, David Dantsker, Luigi Grassi, Darío A. Estrin, Joel M. Friedman, Lelio Mazzarella, Guido di Prisco, and Cinzia Verde

Lĩnh vực: Biochemistry, Physiology

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào hệ thống vận chuyển oxy của loài cá Cottoperca gobio, một loài cá thuộc phân nhóm Notothenioidei sống ở vùng cận Nam Cực. Loài cá này có hai loại hemoglobin chính, chia sẻ chung chuỗi β. Bài báo mô tả sự cân bằng, động học liên kết oxy và động lực học phân tử của hai loại hemoglobin này. Các kết quả cho thấy sự điều chỉnh mạnh mẽ của cân bằng và động học liên kết oxy bởi các yếu tố dị thể, thể hiện rõ qua hiệu ứng Bohr và Root. Hemoglobin của C. gobio có ái lực oxy và tính hợp lực giữa các chuỗi cao hơn so với hầu hết các hemoglobin của các loài Notothenioidei sống ở vùng Nam Cực. Mặc dù có tốc độ tái liên kết tương tự, hai loại hemoglobin này cũng thể hiện sự khác biệt đáng kể về động lực học có thể ảnh hưởng đến chức năng. Các mô phỏng động lực học phân tử đã được thực hiện để hiểu rõ hơn cơ sở phân tử của mối quan hệ cấu trúc-chức năng này, đặc biệt tập trung vào vai trò của chuỗi β trong việc tăng tính linh hoạt của vòng CD, có thể liên quan đến ái lực oxy.

Mục lục chi tiết:

– Keywords
– Correspondence
– Database
– Primary structure
– Oxygen equilibria, subunit cooperativity and root effect
– Thermodynamics of oxygen binding
– Rebinding kinetics
– Simulations
– Conclusions
– Experimental procedures
– References
– Supporting information