Báo cáo khoa học: Isolation, characterization, sequencing and crystal structure of charybdin, a type 1 ribosome-inactivating protein from Charybdis maritima agg.

Isolation, Characterization, Sequencing And Crystal Structure Of Charybdin, A Type 1 Ribosome-Inactivating Protein From Charybdis Maritima Agg.

Tác giả: Eleftherios Touloupakis, Renate Gessmann, Kalliopi Kavelaki, Emmanuil Christofakis, Kyriacos Petratos, and Demetrios F. Ghanotakis

Lĩnh vực: Hóa học, Sinh học Phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này mô tả quá trình phân lập, đặc tính hóa và xác định cấu trúc tinh thể của charybdin, một protein mới thuộc loại 1 có khả năng bất hoạt ribosome (RIP), được phân lập từ củ của loài Charybdis maritima agg. Charybdin là một chuỗi polypeptide đơn lẻ, có khối lượng phân tử 29 kDa, và cho thấy khả năng ức chế dịch mã trong hệ thống tế bào lưới hồng cầu thỏ với giá trị IC50 là 27.2 nm. Nghiên cứu đã xác định trình tự protein hoàn chỉnh thông qua giải trình tự DNA và protein, cũng như phân tích cấu trúc tinh thể độ phân giải cao. Một phát hiện đáng chú ý là sự thay thế của gốc tyrosine (Tyr) bằng valine (Val) tại vị trí 79 trong vùng hoạt động của protein, điều này có thể giải thích cho hiệu quả ức chế dịch mã in vitro tương đối thấp so với các RIP khác. Cấu trúc của charybdin bao gồm hai miền: một miền N-terminal dạng α+β và một miền C-terminal chủ yếu là α-helical. Vùng hoạt động nằm ở giao diện giữa hai miền.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Database
• Abstract
• Introduction
• Results
• Discussion
• Experimental procedures
• Acknowledgements
• References
• Supplementary material