Insights into the Rrf2 repressor family – the structure of CymR, the global cysteine regulator of Bacillus subtilis

Insights into the Rrf2 repressor family – the structure of CymR, the global cysteine regulator of Bacillus subtilis

Tên đề tài:

Insights into the Rrf2 repressor family – the structure of CymR, the global cysteine regulator of Bacillus subtilis

Tác giả:

William Shepard, Olga Soutourina, Emmanuelle Courtois, Patrick England, Ahmed Haouz, Isabelle Martin-Verstraete

Lĩnh vực:

Cấu trúc tinh thể; chuyển hóa cysteine; cụm Fe-S; tương tác protein-DNA; Rrf2 repressor

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể của CymR, một yếu tố điều hòa toàn cục của quá trình chuyển hóa cysteine ở Bacillus subtilis. CymR thuộc họ các yếu tố điều hòa Rrf2, một họ phổ biến nhưng còn ít được nghiên cứu. Cấu trúc tinh thể cho thấy CymR tồn tại dưới dạng dimer, mỗi đơn phân bao gồm hai miền: một miền liên kết với DNA chứa motif winged helix-turn-helix (wHTH) và một miền dimer hóa dài. Kiến trúc này cho phép các yếu tố điều hòa nhỏ này bao quát các mục tiêu DNA dài 23-27 cặp bazơ. So sánh với các cấu trúc Rrf2 đã biết cho thấy CymR có những điểm tương đồng về cấu trúc miền wHTH với các yếu tố điều hòa thuộc siêu họ GntR như FadR và HutC. Nghiên cứu cũng đề cập đến khả năng CymR tương tác với DNA, các điểm khác biệt cấu trúc giữa CymR và các thành viên khác của họ Rrf2, và thảo luận về vai trò tiềm năng của cụm Fe-S trong hoạt động của các yếu tố điều hòa này. Ngoài ra, các thí nghiệm đo lường tương tác SPR cũng được thực hiện để xác định kích thước tối thiểu của DNA cần thiết cho CymR liên kết hiệu quả.

Mục lục chi tiết: