Flavogenomics – a genomic and structural view of flavin-dependent proteins

Flavogenomics – A Genomic and Structural View of Flavin-Dependent Proteins

Tác giả: Peter Macheroux, Barbara Kappes, Steven E. Ealick

Lĩnh vực: Biochemistry, Chemistry, Biology

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này trình bày một phân tích về 374 protein phụ thuộc vào flavin, xem xét chức năng, cấu trúc và sự phân bố của chúng trong 22 bộ gen của vi khuẩn cổ đại, vi khuẩn, động vật nguyên sinh và sinh vật nhân chuẩn. Phần lớn các enzyme phụ thuộc vào flavin là các oxidoreductase (hơn 90%), với các enzyme còn lại được phân loại là transferase, lyase, isomerase và ligase. FAD là cofactor được sử dụng phổ biến hơn FMN. Các cấu trúc có độ phân giải cao có sẵn cho khoảng một nửa số protein flavin. Nghiên cứu cũng khám phá sự đa dạng về cấu trúc và sự phân bố của các protein flavin trong các bộ gen khác nhau, làm nổi bật sự khác biệt trong việc sử dụng các protein này và vai trò của chúng trong các “lối sống chuyên sâu về flavin”.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Flavin-dependent proteins
• Nature’s flavoprotein arsenal
• Flavoprotein structures
• Impact of structural genomics consortia
• Flavogenomics – occurrence and distribution of flavoproteins in prokaryotes and eukaryotes
• Methods