Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 19 trang
Dung lượng: 811 KB

Giới thiệu nội dung

Conserved Structural Determinants in Three-Fingered Protein Domains

Tác giả: Andrzej Galat, Gregory Gross, Pascal Drevet, Atsushi Sato, André Ménez

Lĩnh vực: Sinh hóa, Cấu trúc protein

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc xác định các yếu tố cấu trúc bảo tồn trong các protein có cấu trúc ba ngón tay (three-fingered protein domains – TFPDs). Các TFPDs có mặt trong nhiều loại protein, bao gồm độc tố rắn, các vùng ngoại bào của thụ thể và các protein được mã hóa bởi gen Ly6 và Plaur. Phân tích cấu trúc ba chiều của nhiều TFPDs đã chỉ ra rằng ba cầu disulfide được bảo tồn cao và một gốc asparagine ở đầu C là thiết yếu cho cấu trúc gấp nếp dạng TFPD. Nghiên cứu làm sáng tỏ sự tương quan giữa các yếu tố cấu trúc này và chức năng đa dạng của các protein TFPD, đồng thời phân biệt rõ ràng cấu trúc TFPD với các cấu trúc tương tự nhưng khác biệt.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Từ khóa
  • Cấu trúc ba chiều của các miền protein ba ngón tay
  • Kết quả và Thảo luận
    • Về sự đa dạng của TFPDs
    • Các cụm tương tác bảo tồn
    • Phân tích sâu hơn các cụm tương tác
    • Phân tích toàn cầu về trình tự của các TFPDs khác nhau
    • Các protein có đặc điểm cấu trúc tương tự TFPDs
  • Kết luận
  • Quy trình thực nghiệm
    • Cơ sở dữ liệu và quy trình tìm kiếm tương đồng trình tự
    • MSA và phân tích của chúng
    • Phân tích cấu trúc
    • Trường lực được sử dụng và tính toán năng lượng
    • Cụm cystine
  • Tài liệu tham khảo
  • Tài liệu bổ sung