Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 51 trang
Dung lượng: 457 KB

Giới thiệu nội dung

XÂY DỰNG QUY TRÌNH ĐỊNH DANH VI KHUẨN GÂY BỆNH LOÉT TRÊN CÂY BƯỞI BẰNG PHƯƠNG PHÁP SINH HỌC PHÂN TỬ

Tác giả: TRẦN THỊ MINH TÚ

Lĩnh vực: CÔNG NGHỆ SINH HỌC

Nội dung tài liệu:

Luận văn này tập trung vào việc xây dựng quy trình định danh vi khuẩn gây bệnh loét trên cây bưởi bằng phương pháp sinh học phân tử. Nghiên cứu sử dụng các kỹ thuật nông học và sinh học phân tử nhằm định danh dòng vi khuẩn *Xanthomonas* sp. gây bệnh loét trên cây bưởi, từ đó hiểu rõ bản chất sinh học của dòng gây bệnh để đề xuất các biện pháp phòng trừ hiệu quả. Đề tài được thực hiện tại phòng thực tập Bệnh cây và Trung tâm Phân Tích Thí Nghiệm của Trường Đại học Nông Lâm, TP. Hồ Chí Minh.

Mục lục chi tiết:

  • Trang bìa
  • Trang tựa
  • Lời cảm ơn
  • Tóm tắt
  • Mục lục
  • Danh sách các hình
  • Danh sách các bảng
  • Danh sách các chữ viết tắt
  • Phần 1. GIỚI THIỆU
    • 1.1. Đặt vấn đề
    • 1.2. Mục đích
    • 1.3. Yêu cầu
    • 1.4. Giới hạn của đề tài
  • Phần 2. TỔNG QUAN
    • 2.1. Sơ lược về nhóm cây có múi trên thế giới và trong nước
      • 2.1.1. Nguồn gốc và phân loại cây bưởi
      • 2.1.2. Giá trị cây ăn quả có múi ở thế giới và trong nước
      • 2.1.3. Tình hình sản xuất cam quýt ở Việt Nam
      • 2.1.4. Tình hình sản xuất cam quýt trên thế giới
    • 2.2. Bệnh loét cam *Xanthomonas citri* (Hasse-Dowson)
      • 2.2.1. Triệu chứng bệnh
      • 2.2.2. Đặc điểm gây bệnh của chủng vi sinh vật gây bệnh (X. a. pv. citri)
    • 2.3. Sơ lược vùng rDNA-ITS
      • 2.3.1. Giới thiệu vùng rDNA
      • 2.3.2. Vùng rDNA-ITS trên Xanthomonas ssp.
    • 2.4. Sơ lược về hrpW gen
    • 2.5. Những cứu về bệnh loét cam quýt trên Thế Giới và Việt Nam
      • 2.5.1. Trên Thế Giới
      • 2.5.2. Tại Việt Nam
    • 2.6. Quy trình định danh Xanthomona sp.
      • 2.6.1. Quy trình định danh Xanthomonas sp. theo phương pháp nuôi cấy, thực hiện phản ứng sinh hóa
      • 2.6.2 Quy trình định danh theo phương pháp phân tử
    • 2.7 Phương pháp PCR
  • Phần 3. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
    • 3.1. Thời gian và địa điểm nghiên cứu
    • 3.2. Nội dung nghiên cứu
    • 3.3 Vật liệu nghiên cứu
    • 3.4. Phương pháp tiến hành
      • 3.4.1 Phân lập, nuôi cấy trên 2 môi trường PGA và YDC, xác định Gram âm hay Gram dương các dòng vi khuẩn gây bệnh loét trên cây bưởi
      • 3.4.2. Chủng bệnh nhân tạo
      • 3.4.3. Thực hiện sắc ký bản mỏng định danh vi khuẩn
      • 3.4.4. Phương pháp ly trích DNA tổng số của vi khuẩn
      • 3.4.5. Khuếch đại vùng 16s-23s rDNA ITS và vùng hrpW gen
        • 3.4.5.1 Khuếch đại vùng 16s-23s rDNA ITS dòng vi khuẩn phân lập với cặp mồi Xan1330 và Xan332
        • 3.4.5.2 Khuếch đại đoạn hrpW gen dòng vi khuẩn phân lập với cặp mồi XACF và XACR
      • 3.5.6. Điện di kiểm tra sản phẩm ly trích và sản phẩm PCR
  • Phần 4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
    • 4.1. Phân lập, xác định gram vi khuẩn gây bệnh loét ở cây bưởi da láng và bưởi đường cam
    • 4.2 Kết quả nuôi cấy vi khuẩn gây bệnh loét trên môi trường PGA và YDC
    • 4.2. Chủng bệnh bệnh nhân tạo
    • 4.3. Sắc ký định danh vi khuẩn gây bệnh
    • 4.4 Ly trích DNA tổng số
    • 4.5. Thực hiện PCR với cặp mồi Xan1330 và Xan 332 trên vùng ITS
    • 4.6 Thực hiện PCR với cặp mồi XACR và XACF trên hrpW gen
  • Phần 5. KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ
    • 5.1. Kết luận
    • 5.2. Đề nghị
  • Phần 6.TÀI LIỆU THAM KHẢO
  • Phần 7. PHỤ LỤC