Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 149 trang
Dung lượng: 2 MB

Giới thiệu nội dung

Nghiên cứu phát triển chỉ thị phân tử phục vụ chọn giống tu hài (Lutraria rhynchaena, Jonas 1844) theo hướng tăng trưởng

Tác giả: Triệu Anh Tuấn

Lĩnh vực: Sinh học (Di truyền học)

Nội dung tài liệu:
Luận án này tập trung vào việc nghiên cứu phát triển các chỉ thị phân tử nhằm mục đích phục vụ công tác chọn giống tu hài (Lutraria rhynchaena, Jonas 1844) theo hướng tăng trưởng. Đề tài bao gồm việc đánh giá thành phần loài tu hài, hiện trạng và tiềm năng phát triển nghề nuôi tại huyện Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh. Đồng thời, luận án cũng tiến hành xây dựng mã vạch DNA để nhận dạng chính xác loài tu hài. Một phần quan trọng của nghiên cứu là giải trình tự toàn bộ hệ gene và hệ gene phiên mã của tu hài, từ đó phát triển bộ chỉ thị SNP. Các chỉ thị SNP này được kỳ vọng sẽ góp phần cải thiện các tính trạng tăng trưởng của tu hài, hỗ trợ công tác chọn tạo giống hiệu quả hơn.

Mục lục chi tiết:

  • Lời cam đoan
  • Lời cảm ơn
  • Danh mục các từ viết tắt
  • Danh mục bảng
  • Danh mục hình
  • Mở đầu
    • Tính cấp thiết của đề tài
    • Mục tiêu nghiên cứu
    • Nội dung nghiên cứu
    • Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của đề tài
    • Đối tượng, phạm vi giới hạn của luận án
    • Những đóng góp mới của luận án
  • Chương 1. Tổng quan nghiên cứu
    • Giới thiệu chung về tu hài
      • Vị trí phân loại học
      • Phân bố tự nhiên
      • Một số đặc điểm cấu tạo tu hài
      • Tình hình nuôi và khai thác tu hài
    • Nghiên cứu chọn giống theo hướng tăng trưởng
      • Chọn lọc dựa trên kiểu hình
      • Chọn lọc theo kiểu gene
    • Chỉ thị phân tử và ứng dụng trong nghiên cứu nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Chỉ thị phân tử
      • Chỉ thị phân tử ứng dụng trong nghiên cứu phân loại
      • Chỉ thị phân tử ứng dụng trong nghiên cứu xây dựng mã vạch DNA ở một số loài
      • Chỉ thị SNP ứng dụng trong nghiên cứu ở các loài hai mảnh vỏ
      • Nghiên cứu giải trình tự hệ gene ở loài hai mảnh vỏ
    • Một số nghiên cứu di truyền phân tử ở tu hài
  • Chương 2. Vật liệu và phương pháp nghiên cứu
    • Vật liệu nghiên cứu
    • Thời gian và địa điểm nghiên cứu
    • Phương pháp nghiên cứu
      • Điều tra thành phần loài tu hài, hiện trạng nghề nuôi tu hài tại Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh và tiềm năng phát triển nghề nuôi tu hài
      • Phương pháp xây dựng mã vạch DNA cho tu hài L. rhynchaena
      • Phương pháp giải trình tự toàn bộ hệ gene tu hài L. rhynchaena
      • Phương pháp giải trình tự hệ gene phiên mã tu hài L. rhynchaena
      • Phương pháp phát triển chỉ thị SNP liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở tu hài
      • Phương pháp phân tích, xử lý dữ liệu
  • Chương 3. Kết quả nghiên cứu và thảo luận
    • Thành phần loài tu hài phân bố tự nhiên tại huyện Vân Đồn, hiện trạng và tiềm năng phát triển nghề nuôi tu hài tại huyện Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh
      • Khảo sát thành phần loài tu hài phân bố tự nhiên tại huyện Vân Đồn
      • Đánh giá hiện trạng và tiềm năng phát triển nghề nuôi tu hài tại huyện Vân Đồn hiện nay
    • Xây dựng mã vạch DNA cho tu hài L. rhynchaena
      • Khảo sát dữ liệu để xây dựng mã vạch DNA vùng gen 16S rRNA, COI của giống Lutraria trên hệ thống mã vạch quốc tế
      • Xây dựng cây phát sinh chủng loại cho các loài tu hài
      • Xây dựng mã vạch DNA để nhận dạng tu hài L. rhynchaena
    • Giải trình tự hệ gene và hệ gene phiên mã của tu hài L. rhynchaena
      • Tách chiết và tinh sạch DNA
      • Thiết lập thư viện và giải trình tự hệ gene và hệ gene phiên mã tu hài
      • Ước lượng kích thước hệ gene tu hài
      • Lắp ráp hệ gene của tu hài L. rhynchaena
      • Ước lượng dị hợp tử, trình tự lặp lại và tìm kiếm đa hình
      • Lắp ráp hệ gene phiên mã
      • Dự đoán và chú thích hệ gene tu hài
      • So sánh đặc điểm hệ gene L. rhynchaena với các loài hai mảnh vỏ
    • Sàng lọc, tuyển chọn và phát triển chỉ thị SNP liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở tu hài
      • Giải trình tự ezRAD-Seq ở tu hài tăng trưởng nhanh và tăng trưởng chậm
      • Xây dựng cơ sở dữ liệu, sàng lọc các SNP ở nhóm tu hài tăng trưởng nhanh và tăng trưởng chậm
      • Sàng lọc outlier loci ở nhóm tu hài tăng trưởng nhanh và tăng trưởng chậm
      • Sàng lọc chỉ thị SNP tiềm năng ở tu hài tăng trưởng nhanh và tăng trưởng chậm
      • Thiết kế mồi và nhân đoạn trình tự chứa chỉ thị SNP tiềm năng sàng lọc được ở nhóm tu hài tăng trưởng nhanh và tăng trưởng chậm
  • Kết luận và đề xuất
  • Công trình đã công bố liên quan đến đề tài luận án
  • Tài liệu tham khảo
  • Phụ lục