Crystal structure of a designed tetratricopeptide repeat module in complex with its peptide ligand

Crystal structure of a designed tetratricopeptide repeat module in complex with its peptide ligand

Tác giả: Aitziber L. Cortajarena, Jimin Wang, Lynne Regan

Lĩnh vực: Molecular Biophysics & Biochemistry, Chemistry

Nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể X-quang của một protein TPR được thiết kế (CTPR390) khi phức hợp với peptide phối tử của nó, đó là các gốc C-terminal của protein sốc nhiệt Hsp90 (peptide MEEVD). Cấu trúc này cho thấy một cách sắp xếp đóng gói mới của các mô-đun 3-TPR, tạo thành các siêu xoắn vô hạn trong tinh thể. Đồng thời, cấu trúc cung cấp những hiểu biết sâu sắc về cơ sở phân tử của sự nhận biết phối tử TPR. Protein CTPR390 được thiết kế dựa trên khung cấu trúc CTPR3, với các gốc liên kết đặc hiệu Hsp90 được “ghép” vào bề mặt liên kết phối tử. Nghiên cứu đã xác định cấu trúc tinh thể ở độ phân giải 1.6 Å, cho phép so sánh chi tiết sự tương tác giữa TPR và peptide, đồng thời làm sáng tỏ cơ chế hoạt động của chiến lược thiết kế “ghép chức năng”.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Results
• Overall crystal structure
• Crystal packing – head-to-tail packing
• CTPR390 superhelix – comparison with long TPR arrays
• Structure of individual CTPR390 molecules
• CTPR390-peptide complex
• Atomic details of the CTPR390–Hsp90 interaction
• Discussion
• Experimental procedures
• Protein design
• Cloning of the CTPR390 gene
• Protein expression and purification
• Protein crystallization and data collection
• Structure determination and refinement
• Coordinates
• Acknowledgements
• References