Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: 255 KB

Giới thiệu nội dung

The PAS Fold

Tác giả: Marco H. Hefti, Kees-Jan Françoijs, Sacco C. de Vries, Ray Dixon, Jacques Vervoort

Lĩnh vực: Biochemistry, Molecular Microbiology

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này đề xuất một định nghĩa mới cho “PAS fold”, một cấu trúc protein quan trọng được tìm thấy trong nhiều sinh vật. Dựa trên phân tích cấu trúc và mô hình hóa quy mô lớn, các nhà nghiên cứu đã chỉ ra rằng các motif PAS và PAC, trước đây được coi là riêng biệt, thực sự là một phần của một cấu trúc gấp duy nhất. Nghiên cứu này nhấn mạnh sự cần thiết phải sử dụng thông tin cấu trúc để chú thích các chuỗi protein, thay vì chỉ dựa vào sự tương đồng về trình tự, đặc biệt là khi các protein có sự tương đồng trình tự hạn chế.

Mục lục chi tiết:

  • Introduction
  • Keywords
  • Experimental procedures
    • Description of the modelling templates
    • Structural alignment of the representative PAS structures
    • Alignment strategy
    • Homology modelling
  • Results
    • Alignment of existing structures
    • Large-scale modelling
    • Arabidopsis, Escherichia, Caenorhabditis and Azotobacter – a case study
  • Discussion
  • References