Báo cáo khoa học: Molecular basis for specificities of reactivating factors for adenosylcobalamin-dependent diol and glycerol dehydratases

Molecular Basis for Specificities of Reactivating Factors for Adenosylcobalamin-Dependent Diol and Glycerol Dehydratases

Tác giả: Hideki Kajiura, Koichi Mori, Naoki Shibata, Tetsuo Toraya

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Sinh học phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc làm sáng tỏ cơ sở phân tử cho sự đặc hiệu của các yếu tố tái hoạt hóa đối với các enzyme diol dehydratase và glycerol dehydratase phụ thuộc adenosylcobalamin. Các enzyme này bị bất hoạt bởi cơ chất sinh lý trong quá trình xúc tác, và được tái hoạt hóa bởi các yếu tố chuyên biệt thông qua cơ chế trao đổi cofactor bị hỏng. Nghiên cứu đã điều tra sự tương tác giữa các yếu tố tái hoạt hóa (DDR và GDR) và các enzyme tương ứng (diol dehydratase và glycerol dehydratase) thông qua các thí nghiệm trong ống nghiệm, bao gồm cả việc tái hoạt hóa các holoenzyme bị bất hoạt và kích hoạt các phức hợp enzyme-CN-Cbl không hoạt động. Kết quả cho thấy rằng các yếu tố tái hoạt hóa có khả năng hình thành phức hợp với apoenzyme là yếu tố quyết định sự đặc hiệu của chúng. Phân tích cấu trúc và mô hình hóa cũng hỗ trợ cho kết luận này, gợi ý rằng sự khác biệt về diện tích bề mặt bị che phủ giữa các phức hợp tương thích và không tương thích giải thích cho sự đặc hiệu quan sát được. Nghiên cứu nhấn mạnh vai trò của các yếu tố tái hoạt hóa trong việc phục hồi chức năng của các enzyme B12-phụ thuộc này.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Abstract
• Introduction
• Results
• Specificities of reactivating factors in the reactivation of inactivated holoenzymes
• Specificities of reactivating factors in the activation of inactive enzyme-CN-Cbl complex
• Specificities of reactivating factors in the promotion of exchange of enzyme-bound CN-Cbl for free adeninylpentylcobalamin (AdePeCbl)
• Specificities of reactivating factors in the complex formation with dehydratases
• Specificities of reactivating factors in the inhibition of apoenzymes and the reversal by ATP
• Buried surface areas between the α subunits of reactivating factors and the β subunits of dehydratases
• Discussion
• Experimental procedures
• Materials
• Enzyme and protein assays
• Assays of reactivating factors
• PAGE
• Modeling studies
• Acknowledgements
• References