Luận án Tiến sĩ Y học: Tính đa dạng của hệ vi khuẩn và mối liên quan giữa tình trạng nhiễm một số chủng vi khuẩn đường tiêu hóa với ung thư đại trực tràng

TÍNH ĐA DẠNG CỦA HỆ VI KHUẨN VÀ MỐI LIÊN QUAN GIỮA TÌNH TRẠNG NHIỄM MỘT SỐ CHỦNG VI KHUẨN ĐƯỜNG TIÊU HÓA VỚI UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG

Tác giả: Nguyễn Duy Trường

Lĩnh vực: Y học

Nội dung tài liệu:

Luận án tiến sĩ y học này tập trung nghiên cứu về tính đa dạng của hệ vi khuẩn trong đường tiêu hóa và mối liên quan giữa tình trạng nhiễm một số chủng vi khuẩn đường tiêu hóa với ung thư đại trực tràng. Nghiên cứu xem xét sự đa dạng của hệ vi khuẩn tại mô ung thư đại trực tràng, mô gan và hạch di căn, đồng thời phân tích mối liên quan giữa nhiễm Fusobacterium nucleatum (F. nucleatum) và Bacteroides fragilis (B. fragilis) với giai đoạn bệnh và nguy cơ ung thư đại trực tràng.

Mục lục chi tiết:

• Lời cảm ơn
• Mục lục
• Danh mục chữ viết tắt
• Danh mục bảng
• Danh mục hình
• Danh mục biểu đồ
• Đặt vấn đề
• Chương 1. Tổng quan
  • 1.1. Dịch tễ học ung thư đại trực tràng
    • 1.1.1. Trên thế giới
    • 1.1.2. Ở Việt Nam
  • 1.2. Cơ chế bệnh sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.2.1. Khái niệm
    • 1.2.2. Mô hình và các con đường phát sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.2.3. Các đột biến gen và đường truyền tín hiệu thường gặp trong ung thư đại trực tràng
    • 1.2.4. Vai trò của vi môi trường khối u trong cơ chế bệnh sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.2.5. Đặc điểm hệ vi khuẩn tại tổ chức u và tổ chức di căn ở bệnh nhân ung thư đại trực tràng
  • 1.3. Vai trò của hệ vi khuẩn đường tiêu hóa trong cơ chế bệnh sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.3.1. Đặc điểm hệ vi khuẩn đường tiêu hóa ở người
    • 1.3.2. Một số cơ chế sinh ung thư đại trực tràng liên quan đến hệ vi khuẩn đường tiêu hóa
    • 1.3.3. Vai trò của Fusobacterium nucleatum trong cơ chế bệnh sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.3.4. Tình hình nghiên cứu về mối liên quan giữa F. nucleatum với ung thư đại trực tràng
    • 1.3.5. Vai trò của Bacteroides fragilis trong cơ chế bệnh sinh ung thư đại trực tràng
    • 1.3.6. Tình hình nghiên cứu về mối liên quan giữa B. fragilis với ung thư đại trực tràng
  • 1.4. Các yếu tố nguy cơ gây ung thư đại trực tràng
    • 1.4.1. Tiền sử cá nhân
    • 1.4.2. Tiền sử gia đình
    • 1.4.3. Lối sống và chế độ ăn
    • 1.4.4. Thuốc chống viêm
  • 1.5. Chẩn đoán polyp và ung thư đại trực tràng
    • 1.5.1. Chẩn đoán polyp đại trực tràng
    • 1.5.2. Chẩn đoán ung thư đại trực tràng
  • 1.6. Ứng dụng kỹ thuật 16S rRNA metagenomics trong nghiên cứu tính đa dạng hệ vi khuẩn đường tiêu hóa
    • 1.6.1. Khái niệm
    • 1.6.2. Ứng dụng 16S rRNA metagenomics nghiên cứu mối liên quan giữa hệ vi khuẩn đường tiêu hóa với ung thư đại trực tràng trên thế giới
    • 1.6.3. Ứng dụng 16S rRNA metagenomics nghiên cứu mối liên quan giữa hệ vi khuẩn đường tiêu hóa với ung thư đại trực tràng tại Việt Nam
• Chương 2. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu
  • 2.1. Đối tượng nghiên cứu
    • 2.1.1. Đối tượng
    • 2.1.2. Tiêu chuẩn lựa chọn
    • 2.1.3. Tiêu chuẩn loại trừ
  • 2.2. Địa điểm và thời gian nghiên cứu
    • 2.2.1. Địa điểm
    • 2.2.2. Thời gian
  • 2.3. Phương pháp nghiên cứu
    • 2.3.1. Thiết kế nghiên cứu
    • 2.3.2. Cỡ mẫu và phương pháp chọn mẫu
    • 2.3.3. Thu thập các chỉ tiêu nghiên cứu
    • 2.3.4. Phương tiện, sinh phẩm và quy trình kỹ thuật
  • 2.4. Phương pháp xử lý số liệu
  • 2.5. Đạo đức nghiên cứu
• Chương 3. Kết quả nghiên cứu
  • 3.1. Đặc điểm chung
    • 3.1.1. Đặc điểm tuổi và giới
    • 3.1.2. Đặc điểm vị trí polyp và ung thư đại trực tràng
    • 3.1.3. Đặc điểm mô bệnh học
    • 3.1.4. Đặc điểm giai đoạn bệnh của bệnh nhân ung thư đại trực tràng
    • 3.1.5. Nồng độ CEA huyết tương tại thời điểm chẩn đoán
  • 3.2. Tính đa dạng hệ vi khuẩn tại mô ung thư đại trực tràng, mô gan và hạch di căn
    • 3.2.1. Thành phần hệ vi khuẩn (taxonomic profilling)
    • 3.2.2. Chỉ số đa dạng sinh học alpha (Alpha diversity)
    • 3.2.3. Chỉ số đa dạng sinh học beta (Beta diversity)
    • 3.2.4. Chỉ thị sinh học
  • 3.3. Mối liên quan giữa tình trạng nhiễm F. nucleatum và B. fragilis với ung thư đại trực tràng
    • 3.3.1. Tỷ lệ phát hiện F. nucleatum và B. fragilis tại mẫu mô đại trực tràng
    • 3.3.2. Tải lượng tương đối của F. nucleatum và B. fragilis tại mẫu mô đại trực tràng
    • 3.3.3. Mối liên quan giữa tuổi, giới, vị trí u, nhiễm F. nucleatum và B. fragilis với nguy cơ ung thư đại trực tràng
• Chương 4. Bàn luận
  • 4.1. Đặc điểm chung
    • 4.1.1. Đặc điểm về tuổi và giới
    • 4.1.2. Đặc điểm vị trí ung thư đại trực tràng
    • 4.1.3. Đặc điểm mô bệnh học của bệnh nhân ung thư đại trực tràng
    • 4.1.4. Đặc điểm giai đoạn bệnh của bệnh nhân
    • 4.1.5. Đặc điểm nồng độ CEA huyết tương tại thời điểm chẩn đoán
  • 4.2. Tính đa dạng hệ vi khuẩn tại mô ung thư đại trực tràng, mô gan và hạch di căn
    • 4.2.1. Thành phần hệ vi khuẩn (taxonomic profilling)
    • 4.2.2. Chỉ số đa dạng sinh học alpha (Alpha diversity)
    • 4.2.3. Chỉ số đa dạng sinh học beta (Beta diversity)
    • 4.2.4. Chỉ thị sinh học (Biomarker analysis)
  • 4.3. Mối liên quan giữa F. nucleatum với ung thư đại trực tràng
    • 4.3.1. Tỷ lệ phát hiện F. nucleatum tại mẫu u đại trực tràng
    • 4.3.2. Tải lượng tương đối của F. nucleatum tại mẫu u đại trực tràng
    • 4.3.3. Mối liên quan giữa tuổi, giới, vị trí u và nhiễm F. nucleatum với nguy cơ ung thư đại trực tràng
  • 4.4. Mối liên quan giữa B. fragilis với ung thư đại trực tràng
    • 4.4.1. Tỷ lệ phát hiện B. fragilis tại mẫu u đại trực tràng
    • 4.4.2. Tải lượng tương đối của B. fragilis tại mẫu u đại trực tràng
    • 4.4.3. Mối liên quan giữa tuổi, giới, vị trí u, nhiễm B. fragilis với nguy cơ ung thư đại trực tràng
  • 4.5. Mối liên quan giữa tình trạng đồng nhiễm F. nucleatum và B. fragilis với ung thư đại trực tràng
  • 4.6. Những điểm hạn chế của luận án
• Kết luận
• Kiến nghị
• Danh mục các công trình nghiên cứu khoa học đã công bố có liên quan đến luận án
• Tài liệu tham khảo
• Phụ lục
• Danh sách bệnh nhân