Sàng Lọc In Silico Và In Vitro Các Cấu Trúc Phân Tử Nhỏ Có Khả Năng Tương Tác Với Interleukin-33 Và Thụ Thể St2

Sàng Lọc In Silico Và In Vitro Các Cấu Trúc Phân Tử Nhỏ Có Khả Năng Tương Tác Với Interleukin-33 Và Thụ Thể St2

Tác giả: MAI THÀNH TẤN
Lĩnh vực: Hóa Dược
Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào việc sàng lọc các phân tử nhỏ có khả năng tương tác với Interleukin-33 (IL-33) và thụ thể của nó là ST2, thông qua các phương pháp in silico và in vitro. IL-33 là một cytokine quan trọng trong phản ứng miễn dịch loại 2, và sự tương tác của nó với ST2 đóng vai trò trung tâm trong nhiều bệnh lý viêm và tự miễn như hen suyễn, viêm khớp dạng thấp, Alzheimer, và các bệnh tim mạch. Tuy nhiên, các liệu pháp điều trị hiện tại bằng kháng thể đơn dòng còn hạn chế về chi phí và phương thức sử dụng. Do đó, việc tìm kiếm các tác nhân phân tử nhỏ, có ưu điểm về khả năng hấp thu qua đường uống, chi phí thấp và dễ bảo quản, trở nên cấp thiết. Đề tài này đề xuất các phương pháp in silico tiên tiến để xác định các vị trí gắn kết tiềm năng trên IL-33 và ST2, xây dựng các mô hình dự đoán, và sàng lọc các thư viện hóa chất lớn. Các hợp chất ứng viên sau đó sẽ được thử nghiệm in vitro để đánh giá hoạt tính ức chế tín hiệu IL-33/ST2.

Mục lục chi tiết:

1. Giới thiệu luận án

1.1. Lý do và tính cần thiết của nghiên cứu

1.2. Mục tiêu nghiên cứu

1.3. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu

1.4. Những đóng góp mới của đề tài về mặt lý luận và thực tiễn

1.5. Bố cục của luận án

2. Tổng quan tài liệu

2.1. Giới thiệu về IL-33 và thụ thể ST2

2.2. Các phương pháp in silico trong khám phá thuốc mới

2.3. Các phương pháp in vitro đánh giá tác động ức chế hoạt tính của IL-33/ST2

2.4. Tình hình nghiên cứu trong và ngoài nước

3. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu

3.1. Đối tượng nghiên cứu

3.2. Phương pháp nghiên cứu

3.2.1. Xây dựng cơ sở dữ liệu cho sàng lọc ảo chất ức chế PPI

3.2.2. Phương pháp khảo sát PPI của IL-33/ST2 và xác định các vị trí gắn kết cho phối tử phân tử nhỏ

3.2.3. Phương pháp xây dựng mô hình in silico dựa trên cấu trúc mục tiêu

3.2.4. Phương pháp xây dựng mô hình in silico dựa trên phối tử

3.2.5. Dự đoán tính chất dược động học và độc tính

3.2.6. Thử nghiệm in vitro đánh giá hoạt tính ức chế tương tác IL-33/ST2

4. Kết quả

4.1. Cơ sở dữ liệu cấu trúc hóa học định hướng cho nghiên cứu sàng lọc in silico chất ức chế PPI

4.2. Khảo sát tương tác protein-protein của IL-33/ST2 và xác định các vị trí gắn kết cho phối tử phân tử nhỏ trên mỗi protein bằng các công cụ máy tính

4.2.1. Kết quả khảo sát các điểm nóng của PPI IL-33/ST2

4.2.2. Kết quả xác định các vị trí gắn kết trên IL-33 và ST2