Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: 726 KB

Giới thiệu nội dung

RNA reprogramming of a-mannosidase mRNA sequences in vitro by myxomycete group IC1 and IE ribozymes

Tác giả: Tonje Fiskaa, Eirik W. Lundblad, Jørn R. Henriksen, Steinar D. Johansen, and Christer Einvik

Lĩnh vực: Công nghệ sinh học phân tử, Sinh học phân tử, Tin sinh học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá tiềm năng của các ribozyme nhóm IC1 và IE từ vi nấm nhầy Didymium và Fuligo, cùng với ribozyme Tetrahymena, trong việc tái lập trình RNA cho một trình tự mRNA a-mannosidase bị đột biến. Các trình tự hướng dẫn nội bộ ngẫu nhiên đã được sử dụng để xác định các vị trí có thể truy cập trên mRNA a-mannosidase bị cô lập từ tế bào COS-7 của động vật có vú. Hai vị trí có thể truy cập phổ biến cho tất cả các ribozyme nhóm I đã được xác định và điều tra thêm trong phân tích tái lập trình RNA bằng phương pháp trans-splicing. Các ribozyme vi nấm nhầy đã thực hiện phản ứng trans-splicing với độ trung thực cao, chuyển đổi RNA a-mannosidase bị đột biến thành trình tự loại hoang dã. Phân tích bảo vệ RNA cho thấy các ribozyme vi nấm nhầy thực hiện trans-splicing với hiệu quả tương tự ribozyme Tetrahymena, cho thấy mối tương quan giữa hiệu quả tương đối và các đặc điểm cấu trúc của miền gấp P4-P6, điều này phù hợp với tầm quan trọng của việc gấp nếp hiệu quả cho quá trình trans-splicing của nhóm I intron.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Từ khóa
  • Tác giả
  • Cơ sở nghiên cứu
  • Tái lập trình RNA của các trình tự mRNA a-mannosidase
  • Cấu trúc của các ribozyme nhóm IC1 và IE từ vi nấm nhầy
  • Các ribozyme nhóm IC1 và nhóm IE chọn các vị trí có thể truy cập giống nhau trong trình tự a-mannosidase mRNA
  • Tăng cường độ đặc hiệu của trans-splicing tại các vị trí U1357 và U1381 của RNA a-mannosidase
  • Xác định hiệu quả trans-splicing tại các vị trí U1357 và U1381 của RNA a-mannosidase
  • Thiết kế các cấu trúc ribozyme trans-splicing nhắm mục tiêu các vị trí cụ thể trong các trình tự RNA a-mannosidase bị đột biến
  • Phân tích bảo vệ ribonuclease (RPA) đối với các trình tự RNA a-mannosidase đã trans-spliced
  • Thủ tục thực nghiệm
  • Lập bản đồ các vị trí có thể truy cập trong mRNA a-mannosidase
  • Phân tích RNA trans-splicing và quá trình theo thời gian thực
  • Trans-splicing và RPA
  • Biểu đồ cấu trúc thứ cấp của ribozyme nhóm I và RNA đích a-mannosidase bị đột biến
  • Thiết kế các cấu trúc plasmid
  • Tài liệu tham khảo
  • Lời cảm ơn