Luận văn Thạc sĩ Sinh học: Phân tích biểu hiện một số gen liên quan đến con đường sinh tổng hợp ginsenoside ở sâm Ngọc Linh (Panax vietnamensis Ha et Grushv.)

Phân tích biểu hiện một số gen liên quan đến con đường sinh tổng hợp ginsenoside ở sâm Ngọc Linh (Panax vietnamensis Ha et Grushv.)

Tác giả: Vũ Thị Trinh

Lĩnh vực: Sinh học thực nghiệm

Nội dung tài liệu:

Luận văn này tập trung nghiên cứu phân tích biểu hiện của các gen liên quan đến con đường sinh tổng hợp ginsenoside ở sâm Ngọc Linh (Panax vietnamensis Ha et Grushv.). Nghiên cứu sử dụng dữ liệu hệ gen phiên mã để xác định các gen tham gia vào quá trình sinh tổng hợp này, xây dựng con đường sinh tổng hợp giả định, nhân bản và xác định trình tự của một số gen liên quan. Đồng thời, đề tài đánh giá mức độ biểu hiện của các gen này tại mô lá và thân rễ của cây sâm Ngọc Linh ở các độ tuổi khác nhau, cũng như so sánh sự biểu hiện giữa các mô và độ tuổi. Kết quả nghiên cứu nhằm cung cấp cơ sở khoa học cho việc đánh giá vai trò của yếu tố di truyền trong sinh tổng hợp ginsenoside, một hợp chất có giá trị dược liệu cao.

Mục lục chi tiết:

• DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT
• DANH MỤC BẢNG
• DANH MỤC HÌNH
• MỞ ĐẦU
• CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• 1.1 CHI NHÂN SÂM VÀ SÂM NGỌC LINH
• 1.1.1 Chi Nhân sâm
• 1.1.2 Sâm Ngọc Linh
• 1.2 NGHIÊN CỨU GIẢI TRÌNH TỰ HỆ GEN Ở CÁC LOÀI THUỘC CHI PANAX
• 1.3 NGHIÊN CỨU BIỂU HIỆN CỦA CÁC GEN CHỨC NĂNG Ở CÁC LOÀI THUỘC CHI PANAX
• CHƯƠNG 2. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 2.1. VẬT LIỆU NGHIÊN CỨU
• 2.1.1. Các mẫu sâm nghiên cứu
• 2.1.2. Các cặp mồi sử dụng
• 2.1.3. Hóa chất, thiết bị
• 2.2. PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 2.2.1. Thu mẫu
• 2.2.2. Tách chiết và kiểm tra chất lượng RNA tổng số
• 2.2.3. Tổng hợp cDNA
• 2.2.4. Xây dựng dữ liệu các gen liên quan đến con đường sinh tổng hợp ginsenoside
• 2.2.5. Thiết kế các cặp mồi
• 2.2.6. Nhân gen quan tâm sử dụng phương pháp reverse transcription PCR
• 2.2.7. Xác định trình tự gen quan tâm sử dụng phương pháp Sanger
• 2.2.8. Nghiên cứu biểu hiện một số gen chức năng bằng realtime PCR
• CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• 3.1. KẾT QUẢ TÁCH CHIẾT, TINH SẠCH, KIỂM TRA CHẤT LƯỢNG, ĐỊNH LƯỢNG RNA TỔNG SỐ TỪ MÔ LÁ, THÂN RỄ SÂM NGỌC LINH
• 3.2. KẾT QUẢ XÂY DỰNG CON ĐƯỜNG SINH TỔNG HỢP GINSENOSIDE GIẢ ĐỊNH Ở SÂM NGỌC LINH
• 3.2.1. Thống kê sơ bộ số lượng unigene gắn với mỗi gen
• 3.2.2. Thống kê dữ liệu các unigene cụ thể
• 3.3. KẾT QUẢ PHÂN TÍCH BIỂU HIỆN CÁC GEN LIÊN QUAN ĐẾN CON ĐƯỜNG SINH TỔNG HỢP GINSENOSIDE Ở MẪU LÁ SÂM NGỌC LINH 1 VÀ 4 NĂM TUỔI
• 3.4. KẾT QUẢ PHÂN TÍCH BIỂU HIỆN CÁC GEN LIÊN QUAN ĐẾN CON ĐƯỜNG SINH TỔNG HỢP GINSENOSIDE Ở MẪU THÂN RỄ SÂM NGỌC LINH 1 VÀ 4 NĂM TUỔI
• 3.5. KẾT QUẢ SO SÁNH MỨC BIỂU HIỆN CỦA CÁC GEN LIÊN QUAN ĐẾN TỔNG HỢP GINSENOSIDE GIỮA MÔ LÁ VÀ THÂN RỄ SÂM NGỌC LINH Ở HAI ĐỘ TUỔI
• DANH MỤC CÔNG TRÌNH CỦA TÁC GIẢ
• TÀI LIỆU THAM KHẢO
• PHỤ LỤC
• Phụ lục 3.1 Ma trận so sánh cDNA của một số gen liên quan đến con đường sinh tổng hợp ginsenoside phân lập từ sâm Ngọc Linh với trình tự tham chiếu và trình tự trích xuất từ dữ liệu transcriptome