Luận án Tiến sĩ Sinh học: Nghiên cứu đa hình một số gen liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở cá tra nuôi (Pangasianodon hypophthalmus)

Viết Tên đề tài

Tên đề tài: Nghiên cứu đa hình một số gen liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở cá tra nuôi (Pangasianodon hypophthalmus)

Tác giả: Trần Thị Huyền Trang

Lĩnh vực: Sinh học

Nội dung tài liệu:

Luận án này tập trung nghiên cứu đa hình đơn nucleotide (SNP) trên một số gen thuộc hệ thống yếu tố tăng trưởng tương tự insulin (IGF) có vai trò quan trọng đối với tính trạng tăng trưởng ở cá tra nuôi (Pangasianodon hypophthalmus). Mục tiêu là phân tích cấu trúc các gen liên quan, phát hiện và sàng lọc các SNP, sau đó xác định kiểu gen và phân tích mối liên quan giữa các SNP này với tính trạng tăng trưởng. Nghiên cứu này kỳ vọng sẽ đề xuất các chỉ thị phân tử tiềm năng, hỗ trợ cho công tác chọn giống cá tra theo hướng tăng trưởng nhanh, góp phần nâng cao chất lượng giống và hiệu quả sản xuất thủy sản.

Mục lục chi tiết:

• Lời cam đoan
• Lời cảm ơn
• Mục lục
• Danh mục các ký hiệu, các chữ viết tắt
• Danh mục các bảng
• Danh mục các hình vẽ, đồ thị
• Mở đầu
• Chương 1: Tổng quan
• 1.1. Giới thiệu chung về cá tra nuôi Pangasianodon hypophthalmus
• 1.1.1. Vị trí phân loại và đặc điểm sinh học
• 1.1.2. Tình hình nuôi trồng và giá trị kinh tế
• 1.1.3. Các nghiên cứu liên quan đến chọn giống cá tra
• 1.2. Tăng trưởng (phát triển cơ) ở cá và các gen liên quan
• 1.2.1. Quá trình tăng trưởng ở cá
• 1.2.2. Điều hòa tăng trưởng ở cá
• 1.2.3. Một số gen liên quan đến tính trạng tăng trưởng đã được nghiên cứu ở cá xương
• 1.3. Vai trò, chức năng và đặc điểm cấu trúc của một số gen /protein thuộc hệ thống IGF
• 1.3.1. Vai trò, chức năng của một số protein thuộc hệ thống IGF đối với sự tăng trưởng của sinh vật.
• 1.3.2. Đặc điểm cấu trúc một số gen và protein tương ứng thuộc hệ thống IGF của cá xương.
• 1.4. Cơ sở tiến hành xác định các đa hình đơn nucleotide (SNP) trên một số gen thuộc hệ thống IGF liên quan đến tính trạng tăng trưởng của cá tra nuôi
• 1.4.1. Vai trò quan trọng của SNP trong việc xác định các chỉ thị phân tử liên quan đến tính trạng quan tâm
• 1.4.2. Một số phương pháp xác định SNP (SNP genotyping) trên gen đích
• 1.4.3. Các nghiên cứu về SNP trên một số gen thuộc hệ thống IGF liên quan đến tính trạng tăng trưởng ở cá xương
• 1.4.4. Các gen thuộc hệ thống IGF đã được xác định dựa trên thông tin hệ gen cá tra nuôi.
• Chương 2: Nguyên vật liệu và phương pháp
• 2.1. Nguyên vật liệu
• 2.2. Phương pháp
• 2.2.1. Phân tích cấu trúc của các gen đích
• 2.2.2. Tách chiết DNA tổng số.
• 2.2.3. Khuếch đại các gen bằng phản ứng PCR.
• 2.2.4. Giải trình tự các gen IGF1, IGF2, IGF1R, IGFBP-1, -2, -3, -5, -6, -7 bằng phương pháp Sanger.
• 2.2.5. Kiểm tra tính xác thực của kết quả giải mã bằng Sanger so với trình tự tham chiếu.
• 2.2.6. Phát hiện và sàng lọc các SNP trên các gen đích trên bộ mẫu khởi tạo
• 2.2.7. Xác định các SNP được sàng lọc trên bộ mẫu kiểm nghiệm bằng phương pháp kéo dài một nucleotide (SBE)
• 2.2.8. Phân tích dữ liệu.
• Chương 3: Kết quả
• 3.1. Phân tích cấu trúc của một số gen/protein thuộc hệ thống IGF của cá tra nuôi
• 3.1.1. Các gen mã hóa IGF (IGF1 và IGF2) và các protein tương ứng
• 3.1.2. Gen mã hóa thụ thể IGF1 (IGF1R) và protein tương ứng
• 3.1.3. Một số gen mã hóa IGFBP và các protein tương ứng.
• 3.2. Xác định tính xác thực của trình tự giải mã bằng Sanger so với trình tự tham chiếu
• 3.3. Phát hiện, sàng lọc SNP trên các gen đích thuộc hệ thống IGF trên bộ mẫu khởi tạo.
• 3.3.1. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGF1
• 3.3.2. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGF2
• 3.3.3. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGF1R.
• 3.3.4. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-1
• 3.3.5. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-2
• 3.3.6. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-3
• 3.3.7. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-5
• 3.3.8. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-6.
• 3.3.9. Phát hiện và sàng lọc SNP trên gen IGFBP-7.
• 3.4. Phân tích sự liên quan đến tính trạng tăng trưởng của các SNP được sàng lọc
• 3.4.1. SNP genotyping trên các cá thể thuộc bộ mẫu kiểm nghiệm
• 3.4.2. Phân tích mối liên quan giữa SNP được sàng lọc và tính trạng tăng trưởng của cá tra nuôi
• Chương 4: Thảo luận
• 4.1. Trình tự và cấu trúc hoàn chỉnh của các gen thuộc hệ thống IGF của cá tra nuôi được phân tích tương đồng với các loài cá xương khác
• 4.2. Sự đa dạng di truyền của các gen thuộc hệ thống IGF của cá tra nuôi.
• 4.3. Sự liên quan giữa đa dạng di truyền của các gen thuộc hệ thống IGF với tính trạng tăng trưởng của cá tra nuôi
• 4.4. Phát triển chỉ thị phân tử SNP nhằm ứng dụng chọn giống cá tra theo hướng tăng trưởng
• Kết luận và kiến nghị
• Danh mục công trình của tác giả
• Tài liệu tham khảo
• Phụ lục