Báo cáo khoa học: Fluorescence quenching and kinetic studies of conformational changes induced by DNA and cAMP binding to cAMP receptor protein from Escherichia coli

Fluorescence quenching and kinetic studies of conformational changes induced by DNA and cAMP binding to cAMP receptor protein from Escherichia coli

Tác giả: Magdalena Tworzydło, Agnieszka Polit, Jan Mikołajczak and Zygmunt Wasylewski

Lĩnh vực: Physical Biochemistry, Faculty of Biotechnology, Jagiellonian University, Kraków, Poland

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc khảo sát các biến đổi cấu trúc của protein thụ thể cyclic AMP (CRP) từ vi khuẩn Escherichia coli khi có sự gắn kết với DNA và cAMP. Sử dụng phương pháp làm tắt huỳnh quang và động học nhanh, các nhà nghiên cứu đã phân tích sự thay đổi cấu trúc của protein CRP, đặc biệt là vùng N-terminal và C-terminal, dưới tác động của việc gắn kết với các trình tự DNA khác nhau và phân tử cAMP. Kết quả nghiên cứu cho thấy protein CRP có thể tồn tại ở nhiều trạng thái cấu trúc khác nhau, và sự phân bố của các trạng thái này bị ảnh hưởng bởi việc gắn kết với cAMP và các trình tự DNA đặc hiệu. Phát hiện này làm sáng tỏ cơ chế truyền tín hiệu cấu trúc từ miền C-terminal sang miền N-terminal của protein, một quá trình quan trọng trong việc điều hòa biểu hiện gen.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Abstract
• Introduction
• Results
• Discussion
• Experimental procedures
• Materials
• Plasmids and cells
• DNA sequences
• Purification of proteins
• Fluorescence labeling of CRP
• Fluorescence quenching measurements
• Lifetime measurements
• Stopped-flow FRET measurements
• Acknowledgements
• References