Summary of Doctoral Thesis in Biology: Antimicrobial resistance characteristics and related genes of multidrug-resistant Salmonella

Antimicrobial Resistance Characteristics And Related Genes Of Multidrug-Resistant Salmonella

Tác giả: NGUYEN THANH VIET

Lĩnh vực: Microbiology

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào đặc điểm kháng kháng sinh và các gen liên quan của Salmonella kháng đa thuốc, được phân lập từ các mẫu thịt bán lẻ tại Hà Nội. Với gánh nặng bệnh tật do thực phẩm ngày càng tăng, đặc biệt là các bệnh tiêu chảy do Salmonella gây ra, việc hiểu rõ cơ chế kháng kháng sinh của vi khuẩn này là rất quan trọng. Nghiên cứu sử dụng phương pháp giải trình tự thế hệ mới (NGS) để phân tích các gen kháng kháng sinh, xác định các đột biến mới có thể góp phần vào sự đề kháng. Kết quả nghiên cứu cung cấp thông tin hữu ích cho việc phòng ngừa, kiểm soát dịch bệnh, kiểm soát ô nhiễm thực phẩm và điều chỉnh việc sử dụng kháng sinh trong điều trị và chăn nuôi.

Mục lục chi tiết:

• INTRODUCTION
• The urgency of the thesis
• The objectives of the thesis
• The main contents of the thesis
• Chapter 1. OVERVIEW
• 1.1. Biological characteristics of Salmonella
• 1.2. Genetic characteristics of Salmonella
• 1.2.1. Salmonella genome structure
• 1.2.2. Mechanisms of Antibiotic resistance in Salmonella
• 1.2.3. Relationship between drug resistance and gene mutations
• 1.2.4. Bacterial efflux pumps
• 1.3. Contamination and antibiotic resistance of Salmonella in food
• 1.3.1. In the world
• 1.3.2. In Vietnam
• 1.4. Methods are commonly used in gene expression research
• Next generation sequencing
• Chapter 2. MATERIAL AND METHODS
• 2.1. MATERIAL
• 2.1.1. Samples
• 2.1.2. Culture media, chemicals, antibiotics, and kits
• 2.1.3. Research equipment
• 2.2. METHODS
• 2.2.1. Sampling
• 2.2.2. Identification of Salmonella
• 2.2.3. Antibiotics susceptibility
• 2.2.4. Nex generation sequencing
• 2.2.5. Bioinformatics methods
• 2.2.6. Confirm antimicrobial resistant gene mutations using Sanger sequencing
• 2.2.7. Statistical analyzed
• Chapter 3. RESULTS AND DISCUSSION
• 3.1. Isolate and identify the Salmonella serotype
• 3.1.1. Identify Salmonella results
• 3.1.2. Salmonella serotype results
• 3.2. Antibiotic resistance characteristics of Salmonella isolated
• 3.2.1. The level of antibiotic resistance of Salmonella isolated
• 3.2.2. The number of each Salmonella resistant to antibiotics according to the isolation source
• 3.2.3. Number of Salmonella resistant to each antibiotic according to the isolation source
• 3.2.4. Antibiotic resistance phenotypic