Activator-binding domains of the SWI/SNF chromatin remodeling complex characterized in vitro are required for its recruitment to promoters in vivo

Activator-Binding Domains of the SWI/SNF Chromatin Remodeling Complex Characterized In Vitro Are Required for Its Recruitment to Promoters In Vivo

Tác giả: Monica E. Ferreira, Philippe Prochasson, Kurt D. Berndt, Jerry L. Workman, Anthony P. H. Wright

Lĩnh vực: Sinh học phân tử, Di truyền học

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào vai trò của các miền liên kết với chất hoạt hóa (activator-binding domains) trong phức hợp tái cấu trúc chromatin SWI/SNF, đặc biệt là sự cần thiết của chúng cho việc tuyển mộ phức hợp này đến các vùng điều hòa gen trong môi trường sống của sinh vật. Trước đây, tương tác giữa các miền này và các miền hoạt hóa axit đã được nghiên cứu trong ống nghiệm. Mặc dù việc loại bỏ cả hai miền liên kết với chất hoạt hóa dẫn đến các kiểu hình khác với loại hoang dã, tầm quan trọng tương đối của chúng đối với việc tuyển mộ SWI/SNF đến các gen mục tiêu vẫn chưa được điều tra rõ ràng. Bài báo này trình bày kết quả sử dụng các thử nghiệm miễn dịch kết tủa chromatin (chromatin immunoprecipitation assays) để đánh giá tầm quan trọng cá nhân và tập thể của các miền liên kết với chất hoạt hóa đối với việc tuyển mộ SWI/SNF đến các gen mục tiêu trong môi trường sống.

Nghiên cứu cũng xem xét các hậu quả của việc tuyển mộ SWI/SNF bị lỗi đối với sự hoạt hóa gen mục tiêu. Kết quả cho thấy việc loại bỏ cả hai miền liên kết với chất hoạt hóa gần như loại bỏ hoàn toàn việc tuyển mộ SWI/SNF do galactose gây ra và dẫn đến sự suy giảm trong hoạt hóa phiên mã, có cường độ tương tự như khi mất hoàn toàn hoạt tính của SWI/SNF. Các miền liên kết với chất hoạt hóa trong Swil và Snf5 đóng góp gần như ngang nhau vào việc tuyển mộ SWI/SNF đến mỗi gen được nghiên cứu. Sự cần thiết của việc tuyển mộ SWI/SNF tương quan với các gen GAL được hoạt hóa mạnh mẽ và nhanh chóng bởi galactose.

Mục lục chi tiết:

(Không có thông tin về mục lục chi tiết trong văn bản được cung cấp)