Functional and Genetic Characterization of the Promoter Region of Apolipoprotein H (β2-Glycoprotein I)

Functional and genetic characterization of the promoter region of apolipoprotein H (β2-glycoprotein I)

Tên đề tài: Functional and genetic characterization of the promoter region of apolipoprotein H (β2-glycoprotein I)

Tác giả: Sangita Suresh, F. Yesim Demirci, Iliya Lefterov, Candace M. Kammerer, Rosalind Ramsey-Goldman, Susan Manzi, M. Ilyas Kamboh

Lĩnh vực: Human Genetics, Graduate School of Public Health, University of Pittsburgh

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc đặc tính hóa vùng promoter của apolipoprotein H (APOH) và các biến thể di truyền của nó thông qua các thí nghiệm chức năng in vitro, cũng như điều tra mối quan hệ của chúng với nồng độ β2GPI trong huyết tương người. Các nhà nghiên cứu đã xem xét ảnh hưởng của 12 đa hình nucleotide đơn lẻ (SNPs) tại vùng promoter nằm ở vùng lân cận 5′ của APOH lên hoạt tính luciferase trong các tế bào COS-1 và HepG2. Nghiên cứu cũng đánh giá tác động của các biến thể này lên nồng độ β2GPI trong huyết tương của 799 người da trắng. Các đặc tính gắn kết DNA của promoter APOH được phân tích bằng phép thử dịch chuyển điện di (EMSA) trên tế bào HepG2. Phân tích xóa đoạn tuần tự của vùng lân cận 5′ của APOH và sự bảo tồn trình tự promoter APOH giữa các loài cũng đã được thực hiện. Các biến thể alen của ba SNPs đã cho thấy biểu hiện luciferase thấp hơn đáng kể. Phép thử EMSA đã chứng minh rằng ba biến thể này liên kết cụ thể với protein từ chiết xuất nhân tế bào HepG2. Phân tích haplotype ba vị trí đã phát hiện một haplotype mang alen -32A có liên quan đáng kể đến việc giảm nồng độ β2GPI trong huyết tương. Phân tích xóa đoạn đã xác định vùng promoter cơ bản của APOH nằm trong khoảng 160 bp thượng nguồn của codon ATG, với sự hiện diện của các yếu tố cis-acting quan trọng trong khoảng -166 đến -65. Phân tích bảo tồn giữa các loài cho thấy các yếu tố promoter cơ bản được bảo tồn cao giữa các loài. Tóm lại, nghiên cứu đã đặc tính hóa promoter chức năng của APOH và xác định các biến thể chức năng ảnh hưởng đến hoạt tính phiên mã của promoter APOH.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Results
• Subjects
• Statistical analysis
• Acknowledgement
• References
• Supporting information