Nigrocin-2 peptides from Chinese Odorrana frogs – integration of UPLC/MS/MS with molecular cloning in amphibian skin peptidome analysis

Nigrocin-2 Peptides from Chinese Odorrana Frogs – Integration of UPLC/MS/MS with Molecular Cloning in Amphibian Skin Peptidome Analysis

Tác giả:

Lei Wang, Geisa Evaristo, Mei Zhou, Martijn Pinkse, Min Wang, Ying Xu, Xiaofeng Jiang, Tianbao Chen, Pingfan Rao, Peter Verhaert, and Chris Shaw

Lĩnh vực:

Amphibian, Antimicrobial, Mass Spectrometry, Molecular Cloning, Peptide

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này trình bày một phương pháp đa ngành nhằm xác định và đặc trưng hóa cấu trúc của các peptide mới. Phương pháp này tích hợp kỹ thuật ‘shotgun’ cloning cDNA mã hóa các peptide tiền chất, suy luận cấu trúc peptide có hoạt tính sinh học tiềm năng và xác nhận cấu trúc bằng cách sử dụng chuỗi MS/MS. Nghiên cứu đã làm sáng tỏ cấu trúc sơ cấp của các peptide thuộc họ nigrocin-2 từ dịch tiết da của bốn loài ếch Odorrana của Trung Quốc, bao gồm O. schmackeri, O. livida, O. hejiangensis và O. versabilis. Các peptide tổng hợp tương ứng đã được chứng minh là có hoạt tính kháng khuẩn. Các peptide nigrocin-2 xuất hiện phổ biến trong dịch tiết da của ếch Ranidae châu Á và thuộc nhóm Odorrana, đặc biệt là đa dạng về cấu trúc ở một số loài. Việc tích hợp các công nghệ phân tích phân tử đã cung cấp một phương tiện để xác định nhanh cấu trúc của các peptide mới từ các thư viện tự nhiên phức tạp mà không cần thông tin cơ sở dữ liệu trực tuyến có hệ thống.

Mục lục chi tiết: