Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung


Enzyme kinetics informatics: from instrument to browser


Tác giả:

Neil Swainston, Martin Golebiewski, Hanan L. Messiha, Naglis Malys, Renate Kania, Sylvestre Kengne, Olga Krebs, Saqib Mir, Heidrun Sauer-Danzwith, Kieran Smallbone, Andreas Weidemann, Ulrike Wittig, Douglas B. Kell, Pedro Mendes, Wolfgang Müller, Norman W. Paton and Isabel Rojas


Lĩnh vực:

data analysis; database; enzyme; kinetics; metadata


Nội dung tài liệu:

Bài viết này giới thiệu một hệ thống tích hợp để quản lý dữ liệu động học enzyme, từ giai đoạn thu thập dữ liệu tại thiết bị đến việc hiển thị trên trình duyệt web. Hệ thống này dựa trên hai cơ sở dữ liệu tương tác: SABIO-RK, chứa dữ liệu động học và siêu dữ liệu liên quan, và MeMo-RK, một kho dữ liệu thô thực nghiệm mới. Cả hai hệ thống đều có sẵn công khai qua giao diện trình duyệt web và dịch vụ web, và có thể cấu hình để đảm bảo tính riêng tư của dữ liệu chưa công bố. Người dùng có thể xem cả các tham số động học và dữ liệu thô thực nghiệm, từ đó tăng độ tin cậy. Công cụ phân tích và gửi dữ liệu, KINETICS-WIZARD, đã được phát triển để hỗ trợ các nhà thực nghiệm thực hiện thu thập, phân tích và gửi dữ liệu. Hệ thống này có khả năng mở rộng, cho phép tích hợp với các thiết bị khác và bao gồm nhiều kỹ thuật phân tích. Bài báo cũng thảo luận về các yêu cầu của một hệ thống như vậy, bao gồm việc tính toán các tham số động học từ dữ liệu thực nghiệm, lưu trữ chúng một cách chuẩn hóa và nhất quán để dễ dàng truy vấn, cũng như lưu trữ dữ liệu thực nghiệm thô để tái sử dụng.


Mục lục chi tiết: