Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: 237 KB

Giới thiệu nội dung

Structures and mode of membrane interaction of a short α helical lytic peptide and its diastereomer determined by NMR, FTIR, and fluorescence spectroscopy

Tác giả: Ziv Oren, Jagannathan Ramesh, Dorit Avrahami, N. Suryaprakash, Yechiel Shai, and Raz Jelinek

Lĩnh vực: Hóa sinh, Hóa học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá cấu trúc và cơ chế tương tác của một peptide diệt khuẩn dạng α xoắn với màng tế bào, so sánh với một dạng diastereomer của nó. Sử dụng các kỹ thuật như NMR, FTIR và quang phổ huỳnh quang, các nhà nghiên cứu đã phân tích cấu trúc ba chiều của hai peptide trong các môi trường mô phỏng màng. Kết quả cho thấy cả hai peptide đều có tổ chức lưỡng tính, cho phép chúng tương tác với cả vùng kỵ nước và vùng đầu cực của màng. Mặc dù dạng diastereomer thiếu cấu trúc α xoắn rõ ràng, nó vẫn thể hiện sự phân tách tương tự giữa các vùng cực và kỵ nước. Nghiên cứu nhấn mạnh tầm quan trọng của sự phân tách này trong việc liên kết và phá vỡ màng, vượt trội hơn vai trò của cấu trúc α xoắn hay β gấp. Các phát hiện này cung cấp cái nhìn sâu sắc về cách các peptide diệt khuẩn tương tác với màng tế bào và vai trò của cấu trúc bất đối xứng trong hoạt động của chúng.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Thực nghiệm
  • Vật liệu
  • Tổng hợp và tinh sạch peptide
  • Chuẩn bị liposome
  • Thí nghiệm NMR
  • Tính toán cấu trúc
  • Đo đạc ATR-FTIR
  • Phân tích dữ liệu ATR-FTIR
  • Thử nghiệm màu sắc màng liposome/polydiacetylene
  • Thí nghiệm huỳnh quang và dập tắt tryptophan
  • Đo đạc phát xạ huỳnh quang tryptophan
  • Thí nghiệm dập tắt tryptophan
  • Kết quả
  • Biểu đồ chiếu Schiffer & Edmundson của các peptide
  • Phân tích dữ liệu NMR và xác định cấu trúc thứ cấp
  • Biểu đồ tóm tắt kết nối NOE
  • Tổ chức peptide lưỡng tính
  • Cấu trúc thứ cấp của peptide trong màng lipid lưỡng tính được xác định bằng quang phổ FTIR
  • Biểu đồ phân tích phổ FTIR
  • Bảng thống kê cấu trúc
  • Tương tác peptide với màng được xác định bằng thử nghiệm màu sắc liposome/polydiacetylene
  • Biểu đồ màu sắc
  • Biểu đồ dập tắt huỳnh quang tryptophan
  • Đóng góp của tổ chức lưỡng tính và vị trí giao diện vào sự phá vỡ màng bởi peptide
  • Thảo luận
  • Lời cảm ơn
  • Tài liệu tham khảo