Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 9 trang
Dung lượng: 218 KB

Giới thiệu nội dung

Short-chain dehydrogenases/reductases (SDRs): Coenzyme-based functional assignments in completed genomes

Tác giả: Yvonne Kallberg, Udo Oppermann, Hans Jörnvall, Bengt Persson

Lĩnh vực: Hóa sinh y học và Tin sinh học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này phát triển một hệ thống phân loại chức năng dựa trên các mô típ trình tự để phân biệt các họ và phân họ của siêu họ Short-chain dehydrogenases/reductases (SDRs). Hệ thống này phân loại SDRs thành năm họ chính: cổ điển, mở rộng, trung gian, phân kỳ và phức tạp, dựa trên các đặc điểm trình tự. Phân tích sâu hơn chia các họ cổ điển và mở rộng thành các phân họ dựa trên đặc điểm liên kết coenzyme. Phương pháp này đã được áp dụng thành công cho bộ gen của con người, chuột, ruồi giấm, giun tròn, cây Arabidopsis và nấm men, cho thấy sự đa dạng về phân bố và đặc điểm của SDRs giữa các loài. Nghiên cứu nhấn mạnh khả năng dự đoán chức năng và đặc tính coenzyme của SDRs chỉ dựa trên trình tự sơ cấp.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu về SDRs và sự đa dạng chức năng
  • Hệ thống phân loại SDRs dựa trên mô típ trình tự
  • Năm họ SDRs: cổ điển, mở rộng, trung gian, phân kỳ, phức tạp
  • Phân loại các phân họ trong họ cổ điển và mở rộng dựa trên đặc tính coenzyme
  • Ứng dụng phương pháp phân loại cho dữ liệu bộ gen
  • Thảo luận về chất lượng cơ sở dữ liệu và các vấn đề liên quan
  • So sánh các họ SDRs cổ điển và mở rộng