Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 16 trang
Dung lượng: 224 KB

Giới thiệu nội dung

A single mismatch in the DNA induces enhanced aggregation of MutS

Tên đề tài: A single mismatch in the DNA induces enhanced aggregation of MutS

Tác giả: Nabanita Nag, G. Krishnamoorthy, and Basuthkar J. Rao

Lĩnh vực: Hóa học, Sinh học phân tử, Di truyền học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá cách thức protein MutS, một thành phần thiết yếu trong hệ thống sửa chữa sai sót DNA (MMR), phản ứng với các sai sót trong chuỗi DNA. Sử dụng các phương pháp phân tích thủy động lực học, nghiên cứu chỉ ra rằng sự hiện diện của một sai sót đơn lẻ trong DNA, đặc biệt khi có sự hiện diện của ATP, có thể dẫn đến sự tập hợp (aggregation) quy mô lớn của protein MutS. Sự tập hợp này mạnh mẽ hơn đáng kể so với trường hợp không có sai sót hoặc với các loại sai sót khác. Kết quả cho thấy sự tập hợp này phụ thuộc vào việc thủy phân ATP và có thể đóng vai trò quan trọng trong việc khuếch đại tín hiệu sai sót DNA, giúp hệ thống MMR hoạt động hiệu quả hơn.

Mục lục chi tiết:

  • Hydrodynamic analyses of MutS aggregates
  • MutS interaction with MutL and stoichiometry analyses
  • Analysis of protein binding to DNA
  • ATP induced oligomerization of MutS
  • ATPyS addition ‘poisons’ ATP mediated oligomerization of MutS
  • ATP induced aggregation of MutS is protein concentration dependent
  • MutS aggregation in the presence of duplex DNA senses a single mismatched base pair
  • The role of ATP hydrolysis
  • The role of MutL
  • Effect of ADP and salt
  • Mismatch-dependent MutS aggregation as revealed by centrifugation assays
  • Discussion
  • Mismatch induced aggregation of MutS in relation to current models of MMR
  • Experimental procedures
  • Materials
  • DNA substrate
  • Fluorescence labelling of MutS with fluorescamine
  • DLS: measurement of hydrodynamic radius
  • Centrifugation assay
  • References