Báo cáo khoa học: Endo⁄exo mechanism and processivity of family 18 chitinases produced by Serratia marcescens

Endo/exo Mechanism and Processivity of Family 18 Chitinases Produced by Serratia marcescens

Tác giả: Svein J. Horn, Audun Sørbotten, Bjørnar Synstad, Pawel Sikorski, Morten Sørlie, Kjell M. Vårum and Vincent G. H. Eijsink

Lĩnh vực: Biochemistry, Biotechnology and Food Science, The Norwegian University of Life Sciences; Biotechnology, The Norwegian University of Science and Technology.

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày một phân tích so sánh về ba loại chitinase thuộc họ 18 được sản xuất bởi Serratia marcescens: ChiA, ChiB và ChiC. Các enzyme này được nghiên cứu về cơ chế hoạt động (endo/exo) và khả năng phân giải liên tục (processivity) khi phân giải chitin và chitosan. Kết quả cho thấy ChiA và ChiB hoạt động theo cơ chế exo-processive, phân giải chitin từ hai đầu khác nhau, trong khi ChiC hoạt động theo cơ chế endo-nonprocessive. Nghiên cứu cũng đề cập đến vai trò của các miền liên kết chitin trong việc tăng cường hoạt động của enzyme.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Abbreviations
• Endo/exo mechanism and processivity of family 18 chitinases produced by Serratia marcescens
• The chitinolytic machinery of S. marcescens
• Product formation during degradation of GlcNAc6 with ChiA, ChiB and ChiC
• Degradation of hexamer (A6)
• Degradation of chitin
• HPLC analysis of the degradation of ẞ-chitin by ChiA, ChiB and ChiC
• Product formation curves for ß-chitin degradation
• Degradation of chitosan
• Size-distribution of oligomers during the degradation of chitosan (FA = 0.65) by ChiA
• Size distribution of oligomers during the degradation of chitosan (FA = 0.65) by ChiB
• Size distribution of oligomers during the degradation of chitosan (FA = 0.65) by ChiC
• Composition of dimer, trimer and tetramer fractions at different α during degradation of chitosan (FA = 0.65) by ChiA, B and C
• Discussion
• Experimental procedures
• Chemicals
• Enzymes
• Enzymatic degradation of chitin, GlcNAc6 and chitosan
• Chromatography of oligosaccharides
• ¹H-NMR Spectroscopy
• Acknowledgements
• References