Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 199 trang
Dung lượng: 3 MB

Giới thiệu nội dung

Nghiên cứu xây dựng phương pháp phân tích một số vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ và đặc điểm sinh học phân tử

Tác giả: Phan Thị Thanh Hà

Lĩnh vực: Công nghệ Sinh học

Nội dung tài liệu:

Luận án này tập trung vào việc nghiên cứu và phát triển các phương pháp phân tích vi rút có nguy cơ cao trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ (NTHMV). Đề tài nhấn mạnh vào việc xây dựng quy trình Real-time RT-PCR để phát hiện và định lượng RNA của các vi rút như HEV và HAstV, tuân thủ theo tiêu chuẩn quốc tế ISO 15216-1:2013. Đồng thời, nghiên cứu cũng đề cập đến việc tối ưu hóa các chu trình nhiệt và các điều kiện phản ứng để nâng cao hiệu quả và rút ngắn thời gian phân tích, phục vụ cho công tác xét nghiệm nhanh. Một phần quan trọng khác của luận án là việc phân tích đặc điểm sinh học phân tử của các vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm được phát hiện trong NTHMV, nhằm đánh giá chính xác hơn nguy cơ tiềm ẩn và đề xuất các biện pháp ứng phó hiệu quả.

Mục lục chi tiết:

  • Lời cam đoan
  • Lời cảm ơn
  • Mục lục
  • Danh mục các hình
  • Danh mục các bảng
  • Danh mục ký hiệu và chữ viết tắt
  • Mở đầu
    • Tính cấp thiết của đề tài
    • Mục tiêu nghiên cứu
    • Nội dung nghiên cứu
    • Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của đề tài
    • Tính mới của đề tài
  • Tổng quan
    • Tình hình sản xuất, tiêu thụ nhuyễn thể hai mảnh vỏ và thách thức về an toàn thực phẩm
      • Tình hình sản xuất và tiêu thụ nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Tình hình nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
    • Đặc điểm sinh học các vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Norovirus
      • Hepatitis A virus
      • Hepatitis E virus
      • Astrovirus
    • Quy trình phát hiện và định lượng vi rút trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Các phương pháp tách chiết RNA vi rút
      • Các phương pháp xác định vi rút
    • Các quy trình phát hiện và định lượng vi rút trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ dựa trên kỹ thuật Real-time RT-PCR
    • Ứng dụng công nghệ MGB và LNA nhằm tăng nhiệt độ nóng chảy của bộ mồi, mẫu dò trong phản ứng Real – time RT – PCR
      • Công nghệ MGB (Minor Groove Binders)
      • Công nghệ LNA (Locked Nucleic Acids)
  • Phương pháp xác định kiểu gen vi rút
    • Kỹ thuật Nested RT – PCR
    • Kỹ thuật giải trình tự Sanger
  • Tình hình nghiên cứu sự lưu hành các kiểu gen của NoV, HAV, HEV, HAstV trên thế giới và tại Việt Nam
    • Tình hình nghiên cứu trên thế giới
    • Tình hình nghiên cứu tại Việt Nam
  • Vật liệu và phương pháp nghiên cứu
    • Vật liệu nghiên cứu
      • Vật liệu kiểm soát
      • Mẫu nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Oligonucleotide
      • Hóa chất
      • Thiết bị
    • Phương pháp nghiên cứu
      • Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát hiện và định lượng RNA của HEV và HAstV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Áp dụng quy trình đã xây dựng phát hiện và định lượng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Xác định kiểu gen của các chủng vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm phát hiện được trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
  • Kết quả và bàn luận
    • Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát hiện và định lượng RNA của HEV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Lựa chọn, hiệu chỉnh tổ hợp mồi, mẫu dò cho phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện HEV
      • Tách dòng và tổng hợp RNA mã hóa vùng gen đích của HEV bằng phiên mã in vitro
      • Tối ưu phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện RNA của với chu trình nhiệt theo tiêu chuẩn ISO 15216-1:2013
      • Xây dựng chu trình nhiệt rút gọn cho phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện RNA của HEV phục vụ xét nghiệm nhanh vi rút này
      • Đặc tính kỹ thuật của quy trình Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HEV trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ theo chu trình nhiệt rút gọn và chu trình nhiệt của ISO 15216-1:2013
    • Xây dựng quy trình Real-time RT-PCR phát hiện và định lượng RNA của HAstV từ nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Lựa chọn, hiệu chỉnh tổ hợp mồi, mẫu dò cho phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện HAstV
      • Tách dòng và tổng hợp RNA mã hóa vùng gen đích của HAstV bằng phiên mã in vitro
      • Tối ưu phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện RNA của với chu trình nhiệt theo tiêu chuẩn ISO 15216-1:2013
      • Xây dựng chu trình nhiệt rút gọn cho phản ứng Real-time RT-PCR phát hiện RNA của HAstV phục vụ xét nghiệm nhanh vi rút này
      • Đặc tính kỹ thuật của quy trình Real-time RT-PCR phát hiện, định lượng HAstV trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ theo chu trình nhiệt rút gọn và chu trình nhiệt của ISO 15216-1:2013
    • Áp dụng quy trình đã xây dựng phát hiện vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trên nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trên nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2016
      • Tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trên nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2022
      • So sánh tình trạng nhiễm vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ năm 2016 và năm 2022
    • Phân tích đặc điểm sinh học phân tử của các vi rút gây bệnh truyền qua thực phẩm trên nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Phân tích đặc điểm sinh học phân tử của các chủng NoV phát hiện trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Phân tích đặc điểm sinh học phân tử của các chủng HEV phát hiện trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
      • Phân tích đặc điểm sinh học phân tử của các chủng HAstV phát hiện trong nhuyễn thể hai mảnh vỏ
  • Kết luận và kiến nghị
  • Danh mục các công trình đã công bố của luận án
  • Tài liệu tham khảo