Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 18 trang
Dung lượng: 305 KB

Giới thiệu nội dung

The crystal structure of a hyperthermostable subfamily II isocitrate dehydrogenase from Thermotoga maritima

Tác giả: Mikael Karlström, Ida H. Steen, Dominique Madern, Anita-Elin Fedöy, Nils-Kåre Birkeland and Rudolf Ladenstein

Lĩnh vực: Sinh hóa học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể ở độ phân giải 2.2 Å của dạng apo (không gắn kết với cơ chất) của isocitrate dehydrogenase (IDH) từ vi khuẩn ưa nhiệt cao Thermotoga maritima (TmIDH). TmIDH thuộc họ IDH β-decarboxylating và là IDH ưa nhiệt cao duy nhất được xác định trong phân nhóm II. Cấu trúc được giải quyết dưới dạng dimer, cho thấy một cấu hình mở với sự xoay của các domain. Phân tích so sánh với các IDH mesophilic (ưa nhiệt độ trung bình) trong cùng phân nhóm đã xác định các yếu tố góp phần vào tính chịu nhiệt cao của TmIDH, bao gồm mạng lưới ion lớn hơn, tương tác ion liên chuỗi tăng cường và sự ổn định của các đầu N- và C- của protein thông qua các tương tác ion tầm xa. Các yếu tố khác bao gồm bề mặt có tính tích điện cao hơn và giao diện chuỗi bên kỵ nước hơn.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả và Thảo luận
  • Tinh sạch dạng dimer của TmIDH
  • Đặc điểm cấu trúc và mô tả mô hình
  • So sánh cấu trúc
  • Sự khác biệt giữa các tiểu đơn vị
  • Sự kết hợp dimer
  • Vị trí hoạt động
  • Liên kết cofactor
  • Vị trí phosphoryl hóa giả định
  • Tính chịu nhiệt
  • Đặc điểm bề mặt và tương tác
  • Tương tác ion
  • Mạng lưới ion
  • Liên kết hydro
  • Đột biến định hướng
  • Kết luận về tính chịu nhiệt
  • Thí nghiệm thực nghiệm
  • Đột biến và tinh sạch protein
  • Siêu ly tâm phân tích
  • Đo nhiệt lượng quét vi sai
  • Tinh thể hóa, thu thập dữ liệu và xử lý dữ liệu
  • Thay thế phân tử
  • Tinh thể hóa, sửa đổi mật độ và xây dựng mô hình