Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: 269 KB

Giới thiệu nội dung

The crystal structure of coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase in complex with cobalamin and propane-1,2-diol

Tác giả: Mamoru Yamanishi, Michio Yunoki, Takamasa Tobimatsu, Hideaki Sato, Junko Matsui, Ayako Dokiya, Yasuhiro Iuchi, Kazunori Oe, Kyoko Suto, Naoki Shibata, Yukio Morimoto, Noritake Yasuoka and Tetsuo Toraya

Lĩnh vực: Hóa sinh, Cấu trúc protein

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc tinh thể của enzyme glycerol dehydratase phụ thuộc coenzyme B12, được xác định ở độ phân giải 2,1 Å, khi kết hợp với cobalamin và propane-1,2-diol. Enzyme này tồn tại dưới dạng dimer của dị tam phân αβγ. Cobalamin liên kết tại giao diện giữa các tiểu đơn vị α và β ở chế độ ‘base-on’, với 5,6-dimethylbenzimidazole của phần nucleotide phối trí với nguyên tử coban. Vị trí hoạt động nằm trong một thùng αβ8 (TIM barrel) được hình thành bởi vùng trung tâm của tiểu đơn vị α. Chất nền propane-1,2-diol và cofactor K+ thiết yếu được liên kết bên trong thùng αβ8, phía trên vòng corrin của cobalamin. Các đặc điểm cấu trúc này tương tự như các enzyme diol dehydratase, tuy nhiên có những khác biệt tinh tế trong tương tác giữa các tiểu đơn vị và vị trí liên kết chất nền, giải thích cho sự khác biệt về ái lực và khả năng bất hoạt bởi glycerol.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Thủ tục thực nghiệm
  • Phân tích động học và tính đặc hiệu lập thể của glycerol dehydratase tái tổ hợp
  • Bằng chứng quang phổ EPR về chế độ ‘base-on’ của liên kết cobalamin
  • Cấu trúc tổng thể của glycerol dehydratase trong phức hợp với cobalamin và propane-1,2-diol
  • Vị trí liên kết cobalamin và cấu hình của cobalamin liên kết
  • Vị trí liên kết chất nền và K+
  • Tài liệu tham khảo