Structure of the HIV-1 Rev response element alone and in complex with regulator of virion (Rev) studied by atomic force microscopy

Structure Of The HIV-1 Rev Response Element Alone And In Complex With Regulator Of Virion (Rev) Studied By Atomic Force Microscopy

Tác giả: Jesper Pallesen, Mingdong Dong, Flemming Besenbacher, Jørgen Kjems

Lĩnh vực: Atomic force microscopy; oligomerization; Rev; RNA; RRE

Nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này ứng dụng kỹ thuật kính hiển vi lực nguyên tử (AFM) để quan sát cấu trúc bậc ba của yếu tố phản ứng Rev (RRE) của virus HIV-1, cả khi đứng độc lập và khi kết hợp với protein Rev. Các hình ảnh AFM cho thấy cấu trúc RRE có dạng hình cầu với một phần cuống, phù hợp với mô hình cấu trúc thứ cấp đã được đề xuất trước đó. Khi RRE kết hợp với protein Rev, cấu trúc trở nên dày hơn ở cả phần cuống và phần đầu. Điều này tương thích với mô hình gắn kết, trong đó sự gắn kết của Rev vào vị trí ái lực cao ở stem IIB khởi động quá trình oligomer hóa của protein Rev thông qua sự gắn kết hợp tác dọc theo stem I trong RRE. Nghiên cứu chứng tỏ AFM là một kỹ thuật hữu ích để nghiên cứu các cấu trúc sinh học phức tạp của axit nucleic ở độ phân giải cao.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Present addresses
• Introduction
• Abbreviations
• Results
• Discussion
• Experimental procedures
• Acknowledgements
• References