Pyr RNA binding to the Bacillus caldolyticus PyrR attenuation protein – characterization and regulation by uridine and guanosine nucleotides

Pyr RNA Binding to the Bacillus Caldolyticus PyrR Attenuation Protein – Characterization and Regulation by Uridine and Guanosine Nucleotides

Tác giả: Casper M. Jørgensen, Christopher J. Fields, Preethi Chander, Desmond Watt, John W. Burgner II, Janet L. Smith, Robert L. Switzer

Lĩnh vực: Biochemistry, Biological Sciences

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này khám phá cơ chế điều hòa biểu hiện gen của chuỗi sinh tổng hợp pyrimidine (gen pyr) ở nhiều loại vi khuẩn Gram dương và các vi khuẩn khác. PyrR, một protein quan trọng, liên kết với các đoạn RNA cụ thể trong vùng dẫn đầu của các operon pyr, qua đó thúc đẩy quá trình làm giảm cường độ phiên mã. Phương pháp lọc gắn kết và thử nghiệm điện di di chuyển băng cho phép xác định đặc tính liên kết của PyrR từ Bacillus caldolyticus với các trình tự RNA (vòng gắn kết) từ ba vùng làm giảm cường độ phiên mã của operon pyr. Kết quả cho thấy PyrR gắn kết với ba vòng gắn kết này và sự điều hòa bởi nucleotide tương tự nhau ở cả ba RNA. Hằng số phân ly biểu kiến ở 0°C dao động từ 0.13-0.87 nm khi không có chất điều hòa. Sự hiện diện của nucleotide uridine làm giảm từ ba đến 12 lần hằng số phân ly, trong khi nucleotide guanosine lại làm tăng từ 40 đến 200 lần. Dữ liệu này gợi ý rằng biểu hiện của operon pyr được điều hòa bởi tỷ lệ nucleotide uridine và guanosine nội bào. Nghiên cứu cũng làm rõ vai trò của tỷ lệ này trong việc điều hòa biểu hiện gen pyr.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Abstract
• Results
• Discussion
• Experimental procedures
• References
• Supplementary material