Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 14 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

Low U1 snRNP dependence at the NF1 exon 29 donor splice site

Tác giả: Michela Raponi, Emanuele Buratti, Elisa Dassie, Meena Upadhyaya, Diana Baralle

Lĩnh vực: Splicing, Neurofibromatosis type 1 (NF1)

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào việc đánh giá ảnh hưởng của các biến thể di truyền trong exon 29 của gen NF1 và vùng lân cận tại vị trí nối 5′ (5’SS) đối với quá trình splicing. Kết quả cho thấy chỉ một số ít các đột biến phân tích đã làm thay đổi đáng kể mức độ bao gồm hoặc loại trừ exon 29 khỏi mRNA trưởng thành. Đặc biệt, đột biến nội tại (+5g>a) gây ra hiệu ứng mạnh nhất, dẫn đến việc exon 29 bị loại trừ hoàn toàn. Phát hiện này đã thúc đẩy việc nghiên cứu sâu hơn về khả năng gắn kết của U1 snRNP với vị trí nối 5′ của exon 29. Các phương pháp thử nghiệm bao gồm phân tích trực tiếp khả năng gắn kết của U1 với các vị trí nối loại dại và đột biến, xây dựng hệ thống splicing trong ống nghiệm để đánh giá trực tiếp vai trò của sự bắt cặp giữa U1 snRNA và vị trí nối cho exon 29, cũng như biểu hiện đồng thời các phân tử U1 snRNP đột biến để cố gắng khôi phục sự bao gồm exon 29 trong vivo. Nghiên cứu đã tiết lộ sự phụ thuộc thấp vào sự hiện diện của U1 snRNP, cho thấy rằng định nghĩa vị trí nối cho exon 29 có thể phụ thuộc vào các cơ chế nhận diện 5’SS thay thế.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả
  • Phân tích splicing của các biến thể exon/intron NF1 29 bằng phương pháp minigene
  • Nhận diện 5’SS của intron 29 NF1 bị lỗi
  • Tương tác giữa U1 snRNP và các vị trí nối IVS29
  • Phân tích tương quan chức năng giữa U1 snRNP và vị trí nối NF1 IVS29
  • Khôi phục tương tác U1
  • Thảo luận
  • Quy trình thí nghiệm
  • Tài liệu tham khảo