Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: 139 KB

Giới thiệu nội dung

Hydrogen Bond Positioning in the 599–611 Loop of Thimet Oligopeptidase Is Required for Substrate Selection

Tác giả: Lisa A. Bruce, Jeffrey A. Sigman, Danica Randall, Scott Rodriguez, Michelle M. Song, Yi Dai, Donald E. Elmore, Amanda Pabon, Marc J. Glucksman and Adele J. Wolfson

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Sinh học phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào thimet oligopeptidase (TOP), một enzyme zinc(II) endopeptidase có vai trò trong việc xử lý nhiều peptide sinh lý. Khám phá vai trò của các gốc trong vùng vòng 599–611 của TOP trong việc lựa chọn và xử lý cơ chất. Các thí nghiệm đột biến và mô phỏng phân tử chỉ ra rằng các gốc tyrosine (Tyr605 và Tyr612) trong vòng này đóng vai trò quan trọng trong việc ổn định trạng thái chuyển tiếp thông qua tương tác liên kết hydro. Sự linh hoạt của vòng, được điều chỉnh bởi các gốc glycine (Gly), cho phép định vị các gốc Tyr này để tương tác hiệu quả với cơ chất. Điều thú vị là, một dẫn xuất bradykinin được xử lý khác biệt, cho thấy khả năng có các cơ chế xúc tác thay thế hoặc sự tham gia của các dạng enzyme mở.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Kết quả
    • Nghiên cứu động học – Đột biến Tyr
    • Đột biến Gly
  • Xu hướng hoạt động biến tính
  • Phân tích HPLC
  • Mô hình hóa và mô phỏng phân tử của TOP hoang dã và đột biến
  • Vai trò của các gốc Gly của vòng 599–611 trong việc định vị Tyr605 và Tyr612
  • Khả năng mcaBk có thể được cắt bởi một dạng mở của enzyme
  • Vai trò của Tyr605 và Tyr612 trong xúc tác
  • Thảo luận
  • Tài liệu tham khảo
  • Vật liệu và phương pháp
    • Thuốc thử
    • Đột biến và biểu hiện protein
    • Phân tích HPLC
    • Mô hình hóa và mô phỏng động lực học phân tử