Báo cáo khoa học: Emergence of a subfamily of xylanase inhibitors within glycoside hydrolase family 18

Emergence of a subfamily of xylanase inhibitors within glycoside hydrolase family 18

Tác giả: Anne Durand, Richard Hughes, Alain Roussel, Ruth Flatman, Bernard Henrissat, Nathalie Juge

Lĩnh vực: Sinh hóa học, Sinh học phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này báo cáo việc xác định và đặc tính hóa sinh hóa của một chất ức chế loại XIP từ lúa. Mặc dù ban đầu được phân loại là chitinase, chất ức chế lúa này không thể hiện hoạt tính chitinolytic nhưng cho thấy tính đặc hiệu đối với xylanase GH11 ở nấm tương tự như chất ức chế từ lúa mì. Điều này, cùng với phân tích khoảng 150 thành viên thực vật của họ glycosidase GH18, cung cấp bằng chứng thuyết phục rằng các chất ức chế xylanase được biểu hiện rộng rãi trong họ này và chức năng mới này gần đây đã xuất hiện dựa trên một khung sườn chung. Tính đa chức năng của các thành viên GH18 có ý nghĩa lớn đối với việc chú giải bộ gen và dự đoán chức năng gen. Nghiên cứu này cung cấp thông tin mới giúp hiểu rõ hơn về ý nghĩa sinh học của một số chitinase GH18 ‘bất hoạt’.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Results
• Production and structural characterization of pRIXI
• Functionality of the recombinant proteins
• Interaction of the inhibitors with xylanases
• Discussion
• RIXI is a novel xylanase inhibitor from rice
• XIP-type inhibitors represent a subfamily of GH18
• XIP-type inhibitors have evolved from a common scaffold
• Experimental procedures
• Materials and strains
• Cloning and expression in P. pastoris
• Protein production and purification
• Enzyme assays
• Protein assays and protein sequencing
• Electrospray mass spectrometry (ESI-MS)
• Gel electrophoresis and immunoblotting
• Electrophoretic titration
• Surface plasmon resonance
• Acknowledgements
• References