Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: 299 KB

Giới thiệu nội dung

Electrostatic properties of the structure of the docking and dimerization domain of protein kinase A IIα

Tác giả: Dimitrios Morikis, Melinda Roy, Marceen G. Newlon, John D. Scott, Patricia A. Jennings

Lĩnh vực: Hóa học và Kỹ thuật Môi trường, Hóa sinh

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá đặc tính tĩnh điện của miền kết nối và nhị trùng (D/D) của tiểu đơn vị điều hòa loại IIa của protein kinase A (PKA). Miền D/D này tạo thành một cấu trúc bó bốn xoắn ốc hình chữ X không cộng hóa trị, bao gồm hai đơn vị xoắn ốc-vòng-xoắn ốc. Miền D/D có một lõi kỵ nước mạnh và hai mặt tiếp xúc riêng biệt: một mặt kỵ nước với rãnh cho tương tác protein-protein và một mặt tích điện có thể liên quan đến điều hòa tương tác protein-protein thông qua các thay đổi trạng thái phosphoryl hóa. Nghiên cứu này sử dụng các phép tính điện tĩnh Poisson-Boltzmann để dự đoán các giá trị pKa trung bình, khám phá các tương tác tĩnh điện cụ thể trong cấu trúc và sự đóng gói của miền D/D, và thảo luận về vai trò của các điện tích trong chức năng của nó.

Mục lục chi tiết:

  • Introduction
  • Materials and Methods
  • Sample preparation and NMR spectroscopy
  • Conversion of NMR parameters to structural restraints
  • Monomer structure calculation
  • Dimer structure calculation
  • pKa calculations
  • Structure validations and molecular graphics
  • Results
  • Discussion