Báo cáo khoa học: Direct identification of hydrophobins and their processing in Trichoderma using intact-cell MALDI-TOF MS

Direct identification of hydrophobins and their processing in Trichoderma using intact-cell MALDI-TOF MS

Tác giả: Torsten Neuhof, Ralf Dieckmann, Irina S. Druzhinina, Christian P. Kubicek, Tiina Nakari-Setälä, Merja Penttilä, and Hans von Döhren

Lĩnh vực: Sinh học phân tử, Hóa sinh, Khoa học Nông nghiệp

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày việc áp dụng phương pháp Sắc ký Khối lượng Phân tử Thời gian bay với Ion hóa Ma trận Hỗ trợ Laser trên Tế bào Nguyên vẹn (intact-cell MALDI-TOF MS) để xác định trực tiếp các protein hydrophobin và quá trình xử lý của chúng trong các loài và chủng nấm thuộc chi Trichoderma. Phương pháp này cho phép phát hiện nhanh chóng và trực tiếp thành phần của các protein hydrophobin lớp II, đồng thời có khả năng nhận dạng các loài và chủng Trichoderma (và các loại nấm khác) chỉ từ một lượng sinh khối microgram mà không cần nuôi cấy trước.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Present address
• Abstract
• Abbreviations
• Introduction
• Results: Identification of new Trichoderma hydrophobins by EST search
• ICMS analysis of Trichoderma
• Identification of the class II hydrophobins produced by H. jecorina
• Deviating post-translational processing of hydrophobins in H. jecorina strains
• Hydrophobin patterns in other T. atroviride and T. longibrachiatum strains
• ICMS of class II hydrophobins can distinguish Trichoderma strains at the subspecies level
• Discussion: Hydrophobin patterns, Hydrophobin processing, Hydrophobins as biomarkers for ICMS of filamentous fungi
• Experimental procedures: Reagents and standards, Microbial strains and cultivations, Extraction and preparation of mycelia for MALDI-TOF analysis, Reduction of disulfide bonds, Microbial characterization by MALDI-TOF MS analysis, MS analysis of low-molecular-mass peptides, Database search and alignments – H. jecorina hydrophobins
• Acknowledgements
• References
• Supplementary material