Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 87 trang
Dung lượng: 2 MB

Giới thiệu nội dung

Định Danh và Phân Nhóm Nấm Trichoderma spp. Phân Lập Tại Việt Nam

Tác giả: Nguyễn Thị Khả Tú

Lĩnh vực: Công nghệ Sinh học

Nội dung tài liệu:

Khóa luận tốt nghiệp này tập trung vào việc định danh tên loài và phân nhóm các dòng nấm Trichoderma spp. được phân lập tại Việt Nam. Nghiên cứu kết hợp phương pháp định danh dựa trên hình thái với phân tích trình tự vùng bảo tồn ITS – rDNA và một phần vùng chức năng tefl để đạt được độ chính xác cao. Đồng thời, khóa luận còn thực hiện phân nhóm và xác định mối quan hệ di truyền giữa các dòng Trichoderma phân lập tại Việt Nam, so sánh với dữ liệu của chúng trên thế giới. Mục tiêu là cung cấp dữ liệu chi tiết về quần thể nấm Trichoderma tại các vùng sinh thái, địa lý khác nhau trên lãnh thổ Việt Nam, góp phần vào việc khai thác tiềm năng của loại nấm này như một tác nhân sinh học hiệu quả.

Mục lục chi tiết:

  • TÓM TẮT
  • ABSTRACT
  • MỤC LỤC
  • DANH SÁCH CÁC CHỮ VIẾT TẮT
  • DANH SÁCH CÁC BẢNG
  • DANH SÁCH CÁC HÌNH
  • Chương 1: MỞ ĐẦU
    • 1.1. Đặt vấn đề
    • 1.2. Mục đích
    • 1.3. Yêu cầu
  • Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU
    • 2.1. Giới thiệu về nấm Trichoderma
      • 2.1.1. Phân loại
      • 2.1.2. Nguồn gốc
      • 2.1.3. Đặc điểm hình thái
      • 2.1.4. Đặc điểm sinh lý, sinh hóa, sinh học
      • 2.1.5. Cơ chế đối kháng với nấm gây bệnh cây trồng
    • 2.2. Cấu tạo tế bào Trichoderma
    • 2.3. Các phương pháp định danh tên loài của Trichoderma
    • 2.4. Giới thiệu về vùng rDNA và vùng ITS – rDNA
    • 2.5. Giới thiệu về vùng tefl
    • 2.6. Phương pháp định lượng nồng độ DNA bằng phân tử Mass
    • 2.7. Các nghiên cứu có liên quan đến Trichoderma và vùng rDNA
    • 2.8. Các nghiên cứu có liên quan đến định danh và phân nhóm Trichoderma
  • Chương 3: VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
    • 3.1. Thời gian, địa điểm, đối tượng nghiên cứu
    • 3.2. Hoá chất
    • 3.3. Dụng cụ và thiết bị
    • 3.4. Phục hồi các dòng Trichoderma
    • 3.5. Nhân và thu sinh khối Trichoderma
    • 3.6. Ly trích DNA tổng số Trichoderma
    • 3.7. Kiểm tra kết quả ly trích và pha loãng DNA
    • 3.8. Phản ứng PCR
    • 3.9. Đánh giá kết quả PCR
    • 3.10. Định danh tên loài các dòng Trichoderma
    • 3.11. Phân nhóm tạo phổ hệ di truyền
    • 3.12. Xác định mối quan hệ di truyền 11 dòng Trichoderma Việt Nam với dữ liệu của chúng ở các vùng sinh thái, địa lý khác nhau trên thế giới
  • Chương 4: KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
    • 4.1. Kết quả ly trích DNA
    • 4.2. Kết quả PCR khuếch đại vùng ITS – rDNA và một phần vùng tefl
    • 4.3. Kết quả định danh tên loài
    • 4.4. Kết quả phân nhóm tạo phổ hệ di truyền
      • 4.4.1. Kết quả phân nhóm từ trình tự vùng ITS – rDNA và một phần vùng tefl
      • 4.4.2. Kết quả phân nhóm từ trình tự vùng ITS1, 5.8S và ITS2 – rDNA
    • 4.5. So sánh vùng ITS1 và ITS2 – rDNA với dữ liệu của chúng trên NCBI
    • 4.6. Xác định mối quan hệ di truyền của vùng ITS – rDNA và một phần vùng tefl với dữ liệu của chúng trên thế giới
  • Chương 5: KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ
    • 5.1. Kết luận
    • 5.2. Đề nghị
  • TÀI LIỆU THAM KHẢO
  • PHỤ LỤC