Crystal structure of archaeal highly thermostable L-aspartate dehydrogenase/NAD/citrate ternary complex

Crystal structure of archaeal highly thermostable L-aspartate dehydrogenase/NAD/citrate ternary complex

Tác giả: Kazunari Yoneda, Haruhiko Sakuraba, Hideaki Tsuge, Nobuhiko Katunuma, Toshihisa Ohshima

Lĩnh vực: N/A

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc xác định cấu trúc tinh thể của enzyme L-aspartate dehydrogenase (L-aspDH) có độ bền nhiệt cao từ vi khuẩn cổ Archaeoglobus fulgidus, ở dạng phức hợp ba ngôi L-aspDH/NAD/citrate. Cấu trúc dimeric của L-aspDH từ A. fulgidus đã được tinh chỉnh với độ phân giải 1.9 Å. Mỗi tiểu đơn vị bao gồm hai miền: miền liên kết coenzyme ở đầu N và miền xúc tác ở đầu C. So sánh cấu trúc với L-aspDH từ Thermotoga maritima cho thấy A. fulgidus L-aspDH có cấu trúc đóng, trong khi T. maritima L-aspDH có cấu trúc mở. Nghiên cứu này cung cấp mô tả chi tiết đầu tiên về việc gắn kết cơ chất và coenzyme với L-aspDH, cũng như cơ sở phân tử cho độ bền nhiệt cao của L-aspDH siêu ưa nhiệt.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Keywords
• Results and Discussion
• Overall structure
• Structural comparison of A. fulgidus and T. maritima L-aspDHs
• Substrate binding
• Cofactor binding
• Accessible surface area and hydrogen bonds
• Ion-pair interaction
• Aromatic pair interaction
• Experimental procedures
• Protein expression and purification
• Crystallization
• Data collection
• Phasing and refinement
• Structural analysis and comparison
• Thermal stability
• Acknowledgements
• References
• Supplementary material