Báo cáo khoa học: by nucleotide affinity cleavage: a distinct nucleotide specificity of the C-terminal ATP-binding site

Comparative analysis of the ATP-binding sites of Hsp90 by nucleotide affinity cleavage: a distinct nucleotide specificity of the C-terminal ATP-binding site

Tác giả: Csaba Sőti, Ákos Vermes, Timothy A. J. Haystead, Péter Csermely

Lĩnh vực: Sinh hóa học phân tử, Sinh học tế bào

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này tập trung vào việc phân tích so sánh đặc tính liên kết nucleotide của các vị trí gắn ATP trên protein sốc nhiệt 90 kDa (Hsp90). Các nhà nghiên cứu đã sử dụng kỹ thuật phân cắt ái lực nucleotide oxy hóa để đặc trưng hóa các vị trí liên kết nucleotide của Hsp90. Kết quả cho thấy vị trí N-terminal chủ yếu liên kết với các nucleotide adenosine có vòng adenine nguyên vẹn, trong khi vị trí C-terminal ít đặc hiệu hơn và có thể liên kết với nhiều loại nucleotide purine và pyrimidine. Nghiên cứu cũng cung cấp bằng chứng cho tương tác động giữa các miền của Hsp90 và gợi ý cho việc thiết kế các chất ức chế Hsp90 mới.

Mục lục chi tiết:

• Giới thiệu
• Vật liệu và phương pháp
• Tinh sạch Hsp90
• Phân cắt ái lực nucleotide oxy hóa
• Định lượng liên kết nucleotide
• Liên kết ATP-Sepharose bởi phosphate-liên kết γ
• Đặc tính nucleotide của các vị trí gắn ATP của Hsp90
• Tương tác của các nucleotide không thủy phân với Hsp90
• Các chất tương tự nucleotide được thế khác nhau liên kết tốt hơn với miền C-terminal so với miền N-terminal của Hsp90
• Các dinucleoside polyphosphate và pyrophosphate không chứa sắt liên kết với Hsp90
• Nicotinamide adenine dinucleotides liên kết với miền N-terminal, nhưng không phải với miền C-terminal của Hsp90
• Liên kết của các alarmone với Hsp90
• Liên kết của các chất tương tự nucleotide không chứa sắt và pyrophosphate với Hsp90
• Thảo luận
• Phân cắt ái lực nucleotide như một công cụ để đặc trưng hóa đặc tính của các miền liên kết nucleotide
• Liên kết nucleotide với miền N-terminal của Hsp90
• Liên kết nucleotide với miền C-terminal của Hsp90