A strategy for discovery of cancer glyco-biomarkers in serum using newly developed technologies for glycoproteomics

A strategy for discovery of cancer glyco-biomarkers in serum using newly developed technologies for glycoproteomics

Tác giả: Hisashi Narimatsu, Hiromichi Sawaki, Atsushi Kuno, Hiroyuki Kaji, Hiromi Ito and Yuzuru Ikehara

Lĩnh vực: Research Center for Medical Glycoscience (RCMG), National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST), Tsukuba, Japan

Nội dung tài liệu: Bài viết này trình bày một chiến lược toàn diện để khám phá các dấu ấn sinh học ung thư (glyco-biomarkers) trong huyết thanh, tập trung vào việc phát hiện các glycoprotein bị thay đổi cấu trúc glycosyl hóa bởi tế bào ung thư. Nghiên cứu sử dụng các công nghệ mới phát triển, bao gồm mảng qPCR định lượng cho các gen mã hóa glycosyl hóa để dự đoán cấu trúc glycan, mảng lectin để chọn lọc các lectin phân biệt glycan liên quan đến ung thư, và phương pháp đánh dấu đồng vị phân tử cho việc xác định các protein mang dấu ấn. Chiến lược này nhằm mục đích vượt qua thách thức trong việc phát hiện các glycoprotein có nồng độ thấp trong huyết thanh, đặc biệt là ở giai đoạn sớm của bệnh ung thư. Bài viết mô tả chi tiết từng giai đoạn của chiến lược, từ phân tích biểu hiện gen đến xác định protein cốt lõi và phân tích cấu trúc glycan.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Construction of databases as useful tools for glycomics and glycoproteomics research
• A strategy for cancer glyco-biomarker discovery
• Establishment of a qPCR method for the measurement of 186 human glycogenes
• Lectin microarray – a powerful technology for selection of lectins for cancer glyco-biomarkers
• Determination of core proteins with the specific lectin epitope by the IGOT method
• Verification of glyco-alteration in candidate glycoproteins to determine clinical utility
• Confirmation of glycan structure using MS” technology
• Future challenges in the discovery of glyco-biomarkers
• Acknowledgements
• References