Báo cáo khoa học: A DmpA-homologous protein from Pseudomonas sp. is a dipeptidase specific for b-alanyl dipeptides Hidenobu Komeda and Yasuhisa Asano

A DmpA-homologous protein from Pseudomonas sp. is a dipeptidase specific for β-alanyl dipeptides

Tác giả: Hidenobu Komeda and Yasuhisa Asano

Lĩnh vực: Biotechnology Research Center, Toyama Prefectural University, Toyama, Japan

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này đã xác định trình tự nucleotide của một đoạn DNA bao phủ vùng lân cận của gen R-stereoselective amidase, ramA, từ bộ gen của Pseudomonas sp. MCI3434 và phát hiện một gen bổ sung, bapA, mã hóa một protein có trình tự tương tự với DmpA aminopeptidase từ Ochrobactrum anthropi LMG7991. Protein BapA đã được biểu hiện trong E. coli và tinh chế. Kết quả cho thấy BapA có hoạt tính thủy phân D-Ala-pNA hiệu quả hơn L-Ala-pNA, tương tự như DmpA. Tuy nhiên, BapA lại thể hiện hoạt tính thủy phân mạnh mẽ đối với các dipeptide chứa β-alanine ở đầu N, bao gồm β-Ala-L-Ala, β-Ala-Gly, β-Ala-L-His (carnosine), β-Ala-L-Leu và (β-Ala)2, cũng như β-alaninamide. Dựa trên đặc tính cơ chất độc đáo này, enzyme được đề xuất gọi là β-Ala-Xaa dipeptidase.

Mục lục chi tiết:

• Abstract
• Keywords
• Correspondence
• Results: Characterization of the flanking region of ramA encoding an R-stereoselective amidase from Pseudomonas sp. MCI3434
• Production of BapA in E. coli and its purification
• Effects of pH and temperature on stability and activity of BapA
• Effects of inhibitors and metal ions
• Substrate specificity
• Discussion
• Experimental procedures
• Acknowledgements
• References