Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 12 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

Purification and Structural Characterization of a D-Amino Acid-Containing Conopeptide, Conomarphin, from Conus Marmoreus

Tác giả: Yuhong Han, Feijuan Huang, Hui Jiang, Li Liu, Qi Wang, Yanfang Wang, Xiaoxia Shao, Chengwu Chi, Weihong Du, Chunguang Wang

Lĩnh vực: Biochemistry, Pharmacology

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày việc phân lập và đặc trưng cấu trúc của conomarphin, một conopeptide mới có chứa axit amin D-Phenylalanine (D-Phe) từ nọc của ốc biển Conus marmoreus. Conomarphin là một peptide không chứa cysteine, bao gồm 15 axit amin, có cấu hình D-Phe ở vị trí thứ ba từ C-terminus. Mặc dù có cấu trúc tương đồng với các conotoxin thuộc siêu họ M dựa trên trình tự peptide tín hiệu được mã hóa, conomarphin lại không có sự tương đồng về trình tự với các conotoxin M-siêu họ khác. Thông qua các thử nghiệm phổ cộng hưởng từ hạt nhân (NMR), conomarphin được xác định là có cấu trúc không đổi trong dung dịch, bao gồm một vòng xoắn chặt ở giữa peptide và một xoắn 3₁₀ ở C-terminus. Sự hiện diện của D-Phe13 được chứng minh là yếu tố then chốt cho cấu trúc này, vì việc thay thế bằng L-Phe13 đã làm mất đi vòng xoắn và thay đổi đáng kể cấu trúc tổng thể. Phát hiện này nhấn mạnh vai trò quan trọng của axit amin D-Phe trong việc xác định cấu trúc và có thể là chức năng của conopeptide, đồng thời mở ra khả năng conomarphin đại diện cho một họ conotoxin mới với các đặc tính sinh học cần được khám phá thêm.

Mục lục chi tiết:

  • Introduction
  • Results
    • Purification and primary sequence of conomarphin
    • D-Phe13 in conomarphin
    • cDNA structure of conomarphin
    • Sequence-specific resonance assignments
    • Structural calculation, refinement, and evaluation
    • Structural characterization and comparison
  • Discussion
  • Experimental procedures
    • Materials
    • Purification
    • Peptide synthesis
    • N-terminal sequencing and MS
    • Protease digestion
    • cDNA cloning
    • NMR experiments
    • Restraint set generation
    • Structural computation and refinement
  • Acknowledgements
  • References
  • Supplementary material