Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 16 trang
Dung lượng: Đang cập nhật

Giới thiệu nội dung

Experimental validation of metabolic pathway modeling

An illustration with glycolytic segments from Entamoeba histolytica

Tác giả: Rafael Moreno-Sánchez, Rusely Encalada, Alvaro Marín-Hernández and Emma Saavedra

Lĩnh vực: Departamento de Bioquímica, Instituto Nacional de Cardiología, Mexico

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào việc xác minh mô hình đường phân của ký sinh trùng Entamoeba histolytica bằng cách kết hợp thực nghiệm và mô hình hóa. Mục tiêu là xác định các bước kiểm soát dòng chảy chính trong con đường trao đổi chất này, từ đó có thể nhắm mục tiêu cho các loại thuốc mới để điều trị bệnh amip. Nghiên cứu đã tiến hành phục hồi các đoạn đường phân in vitro sử dụng enzyme tái tổ hợp và song song đó là xây dựng mô hình dựa trên các phương trình tốc độ và tham số động học đã biết. Sự không khớp ban đầu giữa kết quả thực nghiệm và mô hình hóa đã thúc đẩy việc đánh giá lại các tương tác enzyme-chất chuyển hóa. Kết quả cho thấy các tương tác ẩn như ức chế cạnh tranh của 3-phosphoglycerate đối với enolase và của pyrophosphate (PPi) đối với 3-phosphoglycerate mutase và enolase, cũng như sự hoạt hóa của PPi đối với hexokinase, đã được xác định. Việc tích hợp các phát hiện này vào mô hình đã cải thiện đáng kể độ chính xác của dự đoán về sự phân bố kiểm soát dòng chảy, tốc độ dòng chảy và nồng độ chất chuyển hóa, cho phép thực hiện các thí nghiệm in silico để hiểu sâu hơn về cơ chế điều hòa của con đường trao đổi chất.

Mục lục chi tiết không được cung cấp trong tài liệu này.