Investigation and prediction of the severity of p53 mutants using parameters from structural calculations

Investigation and prediction of the severity of p53 mutants using parameters from structural calculations

Tác giả: Jonas Carlsson, Thierry Soussi, Bengt Persson

Lĩnh vực: Ung thư; Mô hình hóa phân tử; Đột biến; Dự đoán cấu trúc

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này trình bày một phương pháp mới nhằm dự đoán ảnh hưởng của các đột biến trong gen ức chế khối u p53. Phương pháp mới này kết hợp các tham số đã được thiết lập trước đó với các tham số mới, trong đó tham số quan trọng nhất là độ ổn định của cấu trúc đột biến được tính toán bằng mô hình hóa phân tử. Đối với mỗi đột biến, một điểm số mức độ nghiêm trọng được đưa ra, có thể sử dụng để phân loại thành các đột biến có hại và không có hại. Phương pháp này xem xét cả các đặc điểm cấu trúc và thuộc tính trình tự, đạt được độ chính xác dự đoán 77% trên tất cả các đột biến và 88% trên các đột biến ung thư vú ảnh hưởng đến liên kết promoter WAF1. So với các phương pháp trước đó trên cùng một bộ dữ liệu, phương pháp này cho kết quả vượt trội, mang lại kiến thức giá trị về p53, một protein được cho là liên quan đến hơn 50% các trường hợp ung thư ở người.