Luận văn: Thiết kế, sàng lọc một số dẫn xuất flavonoid và đánh giá hoạt tính gây độc lên dòng tế bào Hela dựa vào các tính toán hóa lượng tử

Thiết Kế, Sàng Lọc Một Số Dẫn Xuất Flavonoid Và Đánh Giá Hoạt Tính Gây Độc Lên Dòng Tế Bào Hela Dựa Vào Các Tính Toán Hóa Lượng Tử

Tác giả: BÙI THỊ PHƯƠNG THÚY

Lĩnh vực: Hóa lý thuyết và hóa lý

Nội dung tài liệu:
Nghiên cứu này tập trung vào việc thiết kế, sàng lọc và đánh giá hoạt tính gây độc của một số dẫn xuất flavonoid lên dòng tế bào Hela, sử dụng các phương pháp tính toán hóa lượng tử. Các phương pháp phòng và trị bệnh ung thư hiện nay còn hạn chế về tác dụng phụ. Nhu cầu về dược chất kháng ung thư có khả năng phòng và trị bệnh là rất lớn. Nhóm flavonoid, đặc biệt là flavone và isoflavone, có hoạt tính kháng oxy hóa, kháng ung thư, kháng viêm. Tuy nhiên, các nghiên cứu thực nghiệm về nhóm này còn hạn chế. Nghiên cứu này sử dụng các thông tin mô tả cấu trúc phân tử, kết hợp với các kỹ thuật phân tích như hồi quy, mạng nơ ron để xây dựng các mối quan hệ định lượng cấu trúc – hoạt tính (QSAR). Các dẫn xuất flavonoid được tối ưu hóa và mô tả bằng các tham số 2D, 3D. Các mô hình QSAR được xây dựng để xác định các yếu tố cấu trúc ảnh hưởng đến hoạt tính kháng ung thư. Bên cạnh đó, nghiên cứu còn tiến hành chiết tách và phân lập flavonoid từ các nguồn tự nhiên như gừng gió, đậu nành, tía tô, xa kê, actiso, và xác định cấu trúc phân tử của chúng bằng các kỹ thuật hóa lý. Các phân tử flavonoid được phân lập sẽ được dự báo hoạt tính và sử dụng làm chất mẫu để thiết kế các hợp chất mới có hoạt tính cao hơn.

Mục lục chi tiết:

• CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
• CHƯƠNG 2. NỘI DUNG & PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
• 2.1. SƠ ĐỒ NGHIÊN CỨU
• 2.2. CƠ SỞ DỮ LIỆU, NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
• 2.2.1. Xây dựng cơ sở dữ liệu thông tin phân tử
• 2.2.2. Nguyên liệu và phương pháp
• 2.2.2.1. Phần mềm ứng dụng
• 2.2.2.2. Hóa chất, thiết bị
• 2.2.2.3. Nguyên liệu
• 2.3. NGHIÊN CỨU LÝ THUYẾT
• 2.3.1. Phương pháp tính toán thông tin cấu trúc
• 2.3.1.1. Cơ học phân tử
• 2.3.1.2. Hóa lượng tử
• 2.3.1.3. Các tham số cấu trúc
• 2.3.2. Xây dựng các mô hình QSAR
• 2.4. SÀNG LỌC, PHÂN LẬP FLAVONOID TỰ NHIÊN
• 2.4.1. Phân lập các hợp chất flavonoid
• 2.4.2. Xác định cấu trúc hóa học các hợp chất flavonoid
• 2.4.2.1. Phương pháp phổ cộng hưởng từ hạt nhân
• 2.4.2.2. Đo nhiễu xạ tia X đơn tinh thể
• 2.4.3. Kỹ thuật thử hoạt tính in vitro
• 2.4.3.1. Nguyên tắc phương pháp Sulforhodamine B
• 2.4.3.2. Nuôi cấy tế bào
• 2.4.3.3. Nhuộm SRB
• 2.4.3.4. Xử lý kết quả
• 2.4.3.5. Xác định GI50
• 2.5. THIẾT KẾ VÀ DỰ BÁO HOẠT TÍNH CỦA FLAVONOID
• CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN
• 3.1. NGHIÊN CỨU LÝ THUYẾT
• 3.1.1. Phương pháp tính toán thông tin cấu trúc
• 3.1.1.1. Cơ học phân tử
• 3.1.1.2. Hóa lượng tử
• 3.1.2. Tham số cấu trúc
• 3.1.2.1. Tham số điện tích
• 3.1.2.2. Phổ 13C-NMR, 15O-NMR và độ dịch chuyển hóa học
• 3.1.2.3. Tham số hóa lý
• 3.1.2.4. Tham số hình học 2D, 3D
• 3.2. XÂY DỰNG MÔ HÌNH QSAR
• 3.2.1. Khảo sát các biến số mô hình
• 3.2.2. Xây dựng các mô hình QESAR
• 3.2.2.1. Mô hình tuyến tính QESARMLR
• 3.2.2.2. Mô hình mạng thần kinh QESARANN
• 3.2.2.3. Kiểm tra khả năng dự đoán
• 3.2.3. Xây dựng các mô hình QSDAR
• 3.2.3.1. Mô hình tuyến tính QSDARMLR
• 3.2.3.2. Mô hình mạng thần kinh QSDARANN
• 3.2.4. Xây dựng mô hình QSSRMLR
• 3.2.4.1. Nguyên tắc xây dựng
• 3.2.4.2. Tính toán các tham số hóa lý
• 3.2.4.3. Xây dựng mô hình
• 3.2.4.4. Kiểm tra khả năng dự đoán
• 3.2.5. Xây dựng mô hình QSARMLR (3.16) và QSARANN(1)
• 3.2.5.1. Dữ liệu
• 3.2.5.2. Xây dựng mô hình QSARMLR (3.16)
• 3.2.5.3. Xây dựng mô hình QSARANN(1)
• 3.2.5.4. Khả năng dự đoán của mô hình QSARMLR (3.16) và QSARANN(1)
• 3.2.6. Xây dựng mô hình QSARMLR (3.17), QSARPCR; QSARPCA-ANN
• 3.2.6.1. Dữ liệu
• 3.2.6.2. Xây dựng mô hình QSARMLR (3.17), QSARPCR
• 3.2.6.3. Xây dựng mô hình QSARPCA-ANN
• 3.2.6.4. Khả năng dự đoán của các mô hình