Luận án: Assessment Of The Diversity And The Role Of Some Modules In The Structure Of Cellulolytic Enzymes Of Bacteria In Thegoa’s Rumen.

ASSESSMENT OF THE DIVERSITY AND THE ROLE OF SOME MODULES IN THE STRUCTURE OF CELLULOLYTIC ENZYMES OF BACTERIA IN THEGOAT’S RUMEN

Tác giả: Nguyen Khanh Hoang Viet

Lĩnh vực: Biotechnology

Nội dung tài liệu:

Nghiên cứu này tập trung vào việc đánh giá sự đa dạng và vai trò của các mô-đun trong cấu trúc của enzyme phân giải cellulose từ vi khuẩn trong dạ cỏ dê. Với sự phát triển của nông nghiệp quy mô lớn và nhu cầu thay thế nhiên liệu hóa thạch bằng các nguồn năng lượng tái tạo, việc nghiên cứu các enzyme phân giải lignocellulose, đặc biệt là cellulase, trở nên cấp thiết. Phương pháp metagenomics được sử dụng để khai thác tài nguyên di truyền phong phú từ các vi sinh vật, bao gồm cả những loài chưa được nuôi cấy. Nghiên cứu đã phân tích 816 gen mã hóa cellulase từ dữ liệu DNA metagenome của vi khuẩn trong dạ cỏ dê Việt Nam, xác định sự đa dạng của các họ GH (Glycosyl Hydrolase) và cấu trúc mô-đun của enzyme. Đặc biệt, nghiên cứu tập trung vào các mô-đun FN3 và Ig, vốn được cho là có vai trò quan trọng trong hoạt tính xúc tác của enzyme. Các kết quả cho thấy sự hiện diện của các mô-đun này trong nhiều loại cellulase khác nhau, và bước đầu khám phá vai trò tiềm năng của chúng trong việc tăng cường hiệu quả phân giải cellulose.

Mục lục chi tiết:

• Chương 1: Tổng quan (Cellulose, Cellulase, Metagenomics trong khai thác gen)
• Chương 2: Vật liệu và phương pháp (Vật liệu, hóa chất, thiết bị; Các phương pháp kỹ thuật sinh học phân tử, vi sinh vật; Các phương pháp hóa sinh protein; Các phương pháp tin sinh học; Xử lý dữ liệu)
• Chương 3: Kết quả và thảo luận (Đa dạng GH và cấu trúc mô-đun của cellulase được suy ra từ 816 khung đọc mở; Đánh giá sự đa dạng và cấu trúc của các họ cellulase GH; Đánh giá sự đa dạng cấu trúc của cellulase phân tử hoàn chỉnh; Đánh giá sự đa dạng của các ORF mã hóa cellulase; Đánh giá sự tương đồng trình tự axit amin suy ra từ các ORF mã hóa cellulase đã chú thích; Dự đoán đặc tính của enzyme dựa trên trình tự; Lựa chọn trình tự các enzyme phân tử điển hình để điều tra vai trò của các mô-đun; Điều tra cấu trúc ba chiều của enzyme chứa mô-đun FN3; Dự đoán giá trị pI và pH của enzyme chứa mô-đun FN3 dựa trên trình tự; Nhân bản gen XFn3Egc; Phân tích mã bộ ba tối ưu của trình tự XFn3Egc)