Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 169 trang
Dung lượng: 2 MB

Giới thiệu nội dung

Nghiên Cứu Đa Hình/Đột Biến Gen CYP2C9, CYP2C19, CYP3A5 Và CYP2D6 Cytochrome P450 Ở Người Kinh Việt Nam

Tác giả: Vũ Phương Nhung

Lĩnh vực: Sinh học

Nội dung tài liệu: Luận án tiến sĩ tập trung nghiên cứu về đa hình và đột biến của các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP3A5 và CYP2D6 cytochrome P450 trong quần thể người Kinh Việt Nam. Nghiên cứu nhằm xây dựng cơ sở dữ liệu về đa hình/đột biến của các gen này, xác định kiểu gen, tần số allele, đồng thời phân tích và dự đoán chức năng của các biến thể mới. Các phương pháp nghiên cứu bao gồm giải trình tự Sanger, PCR, MLPA, Long range PCR, Real-time PCR và phân tích in silico. Kết quả nghiên cứu cung cấp thông tin khoa học về đa dạng di truyền của các gen CYP450, làm tiền đề cho việc phát triển lĩnh vực di truyền dược học và y học cá thể, góp phần tối ưu hóa hiệu quả sử dụng thuốc cho người Việt Nam.

Mục lục chi tiết:

  • Lời cam đoan
  • Lời cảm ơn
  • Danh mục các chữ viết tắt dùng trong luận án
  • Danh mục bảng
  • Danh mục hình
  • Mở đầu
  • Chương 1: Tổng quan
    • 1.1. CYP450 và chuyển hóa thuốc trong gan
    • 1.2. Đa dạng di truyền các gen mã hóa cho enzyme CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc
      • 1.2.1. Gen CYP2C9
      • 1.2.2. Gen CYP2C19
      • 1.2.3. Gen CYP2D6
      • 1.2.4. Gen CYP3A5
    • 1.3. Ảnh hưởng của đa dạng di truyền các gen dược học đối với các ADR và sự khác biệt trong đáp ứng thuốc
      • 1.3.1. Khái quát về các ADR
      • 1.3.2. Một số trường hợp đa dạng di truyền các gen dược học gây nên khác biệt trong đáp ứng thuốc
    • 1.4. Ứng dụng và triển vọng của di truyền dược học trong lâm sàng
    • 1.5. Một số phương pháp nghiên cứu đa dạng di truyền của các gen CYP450
      • 1.5.1. Các phương pháp nghiên cứu SNP và indel
      • 1.5.2. Các phương pháp nghiên cứu CNV
    • 1.6. Tình hình nghiên cứu đa hình di truyền một số gen CYP450 trên người Việt Nam và phạm vi nghiên cứu của luận án
      • 1.6.1. Tình hình nghiên cứu đa hình di truyền của các gen CYP450 tại Việt Nam và trên thế giới
      • 1.6.2. Phạm vi nghiên cứu của luận án
  • Chương 2: Vật liệu và phương pháp nghiên cứu
    • 2.1. Đối tượng nghiên cứu
    • 2.2. Các thiết bị, dụng cụ được sử dụng trong nghiên cứu
    • 2.3. Phương pháp nghiên cứu
      • 2.3.1 Tách chiết DNA tổng số
      • 2.3.2. Xác định nồng độ DNA tổng số
      • 2.3.3. Phương pháp PCR Khuếch đại đặc hiệu các gen
        • 2.3.3.1. Thiết kế mồi
        • 2.3.3.2. PCR đặc hiệu các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5
      • 2.3.4. Giải trình tự Sanger
        • 2.3.4.1. PCR giải trình tự
        • 2.3.4.2. Tinh sạch sản phẩm PCR giải trình tự
        • 2.3.4.3. Biến tính sản phẩm PCR và điện di mao quản trên máy giải trình tự
      • 2.3.5. Phương pháp MLPA
        • 2.3.5.1. Thực hiện phản ứng MLPA
        • 2.3.5.2. Điện di mao quản phân tách đoạn
        • 2.3.5.3. Phân tích kết quả bằng phần mềm Coffalyzer
      • 2.3.6. Long range (LR) PCR
      • 2.3.7. Real-time PCR
      • 2.3.8. Phân tích số liệu nghiên cứu
        • 2.3.8.1. Phân tích kết quả giải trình tự Sanger và đánh giá trạng thái cân bằng di truyền Hardy-Weinberg của quần thể
        • 2.3.8.2. Phân tích thống kê
      • 2.3.9. Dự đoán chức năng in silico của các biến thể mới
        • 2.3.9.1. Dự đoán chức năng của các biến thể mới trong vùng mã hóa
        • 2.3.9.2. Dự đoán chức năng của các biến thể mới trong vùng không mã hóa
        • 2.3.9.3. Dự đoán chức năng của các biến thể mới trong vùng promoter
  • Chương 3: Kết quả và thảo luận
    • 3.1. Tách chiết DNA tổng số
    • 3.2. Khuếch đại đặc hiệu các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, CYP3A5 và giải trình tự
    • 3.3. Phân tích đa hình/đột biến các gen CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 ở quần thể người Kinh Việt Nam
      • 3.3.1. Đa hình/đột biến của gen CYP2C9
      • 3.3.2. Đa hình/đột biến của gen CYP2C19
      • 3.3.3. Đa hình/đột biến của gen CYP2D6
      • 3.3.4. Đa hình/đột biến của gen CYP3A5
    • 3.4. Phân tích liên kết giữa các biến thể trên CYP2C9, CYP2C19 và CYP2D6
    • 3.5. Dự đoán chức năng in silico của các biến thể mới tìm thấy trên CYP2C9, CYP2C19 và CYP2D6
    • 3.6. So sánh tần số allele của các gen nghiên cứu giữa quần thể người Kinh Việt Nam với các quần thể người khác trên thế giới
      • 3.6.1. So sánh tần số allele của gen CYP2C9 giữa quần thể người Kinh Việt Nam với các quần thể người khác trên thế giới
      • 3.6.2. So sánh tần số allele của gen CYP2C19 giữa quần thể người Kinh Việt Nam với các quần thể người khác trên thế giới
      • 3.6.3. So sánh tần số allele của gen CYP2D6 giữa quần thể người Kinh Việt Nam với các quần thể người khác trên thế giới
      • 3.6.4. So sánh tần số allele của gen CYP3A5 giữa quần thể người Kinh Việt Nam với các quần thể người khác trên thế giới
    • 3.7. Thảo luận
      • 3.7.1. Sự phân bố của các SNP gây ảnh hưởng chức năng protein CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6 và CYP3A5 ở các quần thể người trên thế giới
      • 3.7.2. Phân tích liên kết giữa các biến thể và ý nghĩa trong nghiên cứu đa dạng di truyền các gen CYP450
      • 3.7.3. Vai trò của các CNV và SV của các gen nghiên cứu trong đa dạng đáp ứng thuốc cá nhân
      • 3.7.4. Vai trò của các biến thể mới của CYP2C9, CYP2C19 và CYP2D6 đối với chức năng của các protein tương ứng
      • 3.7.5. Ý nghĩa của việc sử dụng thông tin di truyền các gen CYP450 tham gia chuyển hóa thuốc trong tối ưu hiệu quả dùng thuốc trên người Kinh Việt Nam
  • Kết luận và kiến nghị
  • Danh mục công trình của tác giả
  • Tài liệu tham khảo
  • Phụ lục