Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 15 trang
Dung lượng: 398 KB

Giới thiệu nội dung

LẬP CHỈ MỤC CƠ SỞ DỮ LIỆU CẤU TRÚC PROTEIN

Tác giả: Phan Mạnh Thường, Lâm Thị Hoà Bình, Đặng Như Toàn, Đoàn Thiện Minh, Trần Văn Lăng

Lĩnh vực: Khoa học Máy tính, Tin học Y sinh

Nội dung tài liệu:

Bài báo này trình bày một phương pháp lập chỉ mục cho cơ sở dữ liệu cấu trúc protein. Mục tiêu là giải quyết bài toán phức tạp và tốn thời gian trong việc tìm kiếm sự tương đồng về cấu trúc bậc ba của các protein khi số lượng cấu trúc protein ngày càng tăng. Phương pháp đề xuất bao gồm việc phân tích cấu trúc protein để rút ra vector đặc trưng, sau đó xây dựng một cấu trúc cây dựa trên các vector này để lập chỉ mục. Cấu trúc cây chỉ mục này giúp tối ưu hóa không gian lưu trữ và tăng tốc độ, độ chính xác cho việc tìm kiếm cấu trúc protein hoặc các tiểu cấu trúc trong protein.

Mục lục chi tiết:

  • 1. Đặt vấn đề
  • 2. Lập chỉ mục dữ liệu cấu trúc protein
    • a) Rút trích vector đặc trưng
    • b) Chuẩn hoá vector đặc trưng
    • c) Xây dựng cây chỉ mục
  • d) Truy vấn dữ liệu trên cây chỉ mục
  • 3. Một số kết quả thử nghiệm
    • a) Các nguồn dữ liệu cấu trúc protein
    • b) Tổ chức lưu trữ
    • c) Một số kết quả thử nghiệm
  • d) Đánh giá và nhận xét
  • 4. Kết luận
  • Tài liệu tham khảo