Xem trước tài liệu

Đang tải tài liệu...

Thông tin chi tiết tài liệu

Định dạng: PDF
Số trang: 11 trang
Dung lượng: 178 KB

Giới thiệu nội dung

Human-blind probes and primers for dengue virus identification

Tác giả: Catherine Putonti, Sergei Chumakov, Rahul Mitra, George E. Fox, Richard C. Willson, and Yuriy Fofanov

Lĩnh vực: Vi sinh vật học, Tin sinh học

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày một chiến lược mới có tên ‘thiết kế mồi và mồi dò mù vật chủ’ (host-blind probe design), dựa trên việc xác định các trình tự bộ gen đặc trưng, xuất hiện thường xuyên trong bộ gen của mầm bệnh nhưng lại vắng mặt trong bộ gen của vật chủ. Phương pháp này được áp dụng để phân tích 83 trình tự bộ gen của virus Dengue nhằm thiết kế các thử nghiệm microarray. Kết quả cho phép phân biệt rõ ràng bốn nhóm huyết thanh chính và xác định các chủng tương tự nhất trong mỗi nhóm. Phương pháp này hứa hẹn giảm thiểu đáng kể khả năng chẩn đoán sai ở cấp độ huyết thanh, với xác suất xấp xỉ 1:10150.

Mục lục chi tiết:

  • Giới thiệu
  • Từ khóa
  • Tóm tắt
  • Kết quả
    • Human n-mers
    • Human-blind sequences present in each individual viral genome
    • Sequences present in all 83 dengue genomes regardless of serotype
    • Sequences unique for serotype 1 and 2
    • Sequences unique for each individual viral genome
  • In silico array hybridization studies
  • Thảo luận
  • Tài liệu tham khảo
  • Tài liệu bổ sung