Báo cáo khoa học: Solution structure of hirsutellin A – new insights into the active site and interacting interfaces of ribotoxins

Solution Structure Of Hirsutellin A

Tác giả: Aldino Viegas, Elias Herrero-Galán, Mercedes Oñaderra, Anjos L. Macedo, Marta Bruix

Lĩnh vực: Hóa sinh, Cấu trúc phân tử

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này trình bày cấu trúc không gian ba chiều của hirsutellin A (HtA) trong dung dịch, được xác định bằng phương pháp NMR. HtA là một ribotoxin có kích thước trung bình, sở hữu cấu trúc α+β đặc trưng với bề mặt tích điện dương cao. Cấu trúc này cho thấy những điểm tương đồng và khác biệt đáng kể so với các ribotoxin đã biết khác như α-sarcin, đặc biệt ở vùng trung tâm hoạt động. Sự khác biệt trong cấu trúc vùng trung tâm hoạt động, bao gồm sự thay thế tyrosine bằng aspartate tại vị trí D40 và sự sắp xếp của vòng thơm F126, đã tạo ra các tương tác tĩnh điện mới, đóng góp vào hiệu quả độc tế bào của HtA. Nghiên cứu cũng thảo luận về vai trò của các vùng khác nhau như vòng hairpin N-terminal và các vòng lặp trong chức năng protein, tương tác protein-protein và protein-lipid.

Mục lục chi tiết:

• Keywords
• Correspondence
• Database
• Hirsutellin (HtA)
• Ribotoxins
• a-sarcin
• Structure
• Assignment
• Disulfide bonds and structure determination
• Calculation statistics
• PROCHECK analysis
• Description of hirsutellin A structure
• The active site
• Discussion
• The active site: structural and electrostatic basis of HtA function
• Comparison with other structures: structural properties of HtA regions involved in protein-protein or protein-lipid interactions
• Conclusion
• Experimental procedures
• Protein isolation and purification
• NMR spectroscopy and assignment
• Structure calculation
• Acknowledgements
• References