Báo cáo khoa học: Context-dependent effects of proline residues on the stability and folding pathway of ubiquitin

Context-dependent effects of proline residues on the stability and folding pathway of ubiquitin

Tác giả: Maria D. Crespo, Geoffrey W. Platt, Roger Bofill and Mark S. Searle

Lĩnh vực: Biochemistry, Structural Biology

Nội dung tài liệu: Nghiên cứu này khám phá ảnh hưởng của các gốc proline lên độ bền và con đường gấp cuộn của protein ubiquitin. Các đột biến thay thế proline tại ba vị trí khác nhau trong ubiquitin cho thấy những tác động phụ thuộc vào ngữ cảnh đối với độ bền của protein, có thể làm tăng hoặc giảm độ bền. Phân tích động học của protein hoang dã cho thấy một giai đoạn gấp cuộn nhanh, phù hợp với mô hình hai trạng thái. Nghiên cứu cũng chỉ ra rằng các gốc proline đóng vai trò thụ động trong quá trình gấp cuộn, nhưng ảnh hưởng đến độ bền của protein theo nhiều cách.

Mục lục chi tiết:

• Introduction
• Materials and methods
• Protein expression
• NMR structural analysis
• Equilibrium stability measurements
• Kinetics experiments
• Analysis of kinetic data
• Results
• Context-dependent effects of proline substitutions on protein stability
• Structural analysis of the proline mutants by NMR
• Kinetic analysis of ubiquitin folding
• Tolerance to substitutions at the P37P38 site
• Activation parameters for folding and formation of a compact transition state
• Discussion
• Context-dependent effects of proline residues on protein stability
• Apparent two-state model for folding of ubiquitin
• Acknowledgements
• References